要是純論速度的話，當然是FAT最快了！
但是各檔案系統都有優劣，不僅僅是速度一個因素制約使用場景的：
一、FAT（FAT16）檔案系統
這是MS-DOS和最早期的WIN95作業系統中最常見的硬碟分割槽格式。它採用16位的檔案分配表，能支援最大為2GB的硬碟分割槽。
FAT檔案系統優點：FAT（FAT16）是目前應用最為廣泛和獲得作業系統最多的一種磁碟分割槽格式，幾乎所有的作業系統都支援這一種格式，從DOS WINDOWS95/98/NT/ME/2000/XP，甚至LINUX都支援這種分割槽格式。
FAT檔案系統缺點：最大隻支援2GB的分割槽，而且每個分割槽最多隻能有65525個簇。因此磁碟利用效率非常 低。因為在DOS和WINDOWS系統中，磁碟檔案的分配是以簇為單位的，一個簇只分配給一個檔案使用，不管這個檔案佔用整個簇容量的多少。這樣，即使一 個檔案很小的話，它也要佔用一個簇，剩餘的空間便全部閒置在那裡，形成了磁碟空間的浪費。由於分割槽表容量的限制，FAT的分割槽越大，磁碟上每個簇的容量也 越大，造成的浪費也越大。
FAT檔案系統，目前除了一些特殊應用之外，基本上已經不再使用了。試想下，目前主流的硬碟容量已經達到1TB（1TB=1024GB）了，假如使用FAT格式的話，每個分割槽最大隻能2GB，那麼電腦裡面會有多少個碟符呀！
二、FAT32檔案系統
相信大家對FAT32檔案系統不會太陌生，畢竟從Win98開始，FAT32就已經的到了廣泛的應用。FAT32格式採用32位的檔案分配表，使其對磁碟 的能力大大增強，突破了FAT16對每一個分割槽的容量只有2GB的限制。Win95以上的作業系統都支援FAT32格式。
FAT32檔案系統優點：突破了FAT對每一個分割槽的容量只有2GB的限制，可以支援大到2TB（2048G）的分割槽。在不超過8GB的分割槽容量下，每個簇的容量都固定為4KB，與FAT16相比，可以大大減少磁碟的浪費，提高磁碟利用率。
FAT32檔案系統缺點：用 FAT32格式分割槽的磁碟，由於檔案分配表的擴大，執行速度比採用FAT16格式分割槽的磁碟要慢，且DOS系統和某些早期的應用軟體不支援這種分割槽格式。 另外還有一個致命的缺點讓FAT32逐漸被淘汰，這就是FAT32的單個檔案最大隻能支援4GB。現在已經進入高畫質時代，720P和1080P高畫質影片文 件都很容易超過4GB，因此FAT32已經走向沒落。
三、NTFS檔案系統
NTFS是從Windows XP系統開始逐漸成為主流的磁碟格式，是微軟Windows NT核心的系列作業系統支援的、一個特別為網路和磁碟配額、檔案加密等管理安全特性設計的磁碟格式。支援NTFS磁碟格式的作業系統有：WINDOWS NT、WINDOWS2000、WINDOWS2003、WINDOWS XP、WINDOWS vista、WINDOWS7等。因此NTFS目前仍是主流的磁碟格式，有大量使用者在使用。
NTFS檔案系統優點：NTFS分割槽具有極高的安全性和穩定性，在使用中不易產生檔案碎片。它能對使用者的操作 進行記錄，透過對使用者許可權進行非常嚴格的限制，使每個使用者只能按照系統賦予的許可權進行操作，充分保護了系統與資料的安全。另外對大部分使用者而言，NTFS 最直觀的優點是，單個檔案的大小突破了FAT32的4GB的限制。
NTFS檔案系統缺點：NTFS雖然有諸多優點，但這些都是針對傳統機械硬碟而設計的，對於新興的Flash 快閃記憶體材料不一定適用。NTFS分割槽是採用“日誌式”的檔案系統，因為要記錄磁碟的詳細讀寫操作，對隨身碟這種快閃記憶體儲介質會造成較大的負擔，比如同樣存取一個 檔案或目錄，在NTFS系統上的讀寫次數就會比FAT32來得多，理論上NTFS格式的隨身碟比較容易損壞，而且400MB以下的分割槽也比FAT16更浪費 空間。
四、exFAT檔案系統
exFAT是近年才出現的格式，主要針對移動儲存裝置，什麼快閃記憶體、隨身碟等。因為FAT32格式單個檔案不能超過4G，使用NTFS格式又容易損壞快閃記憶體晶片，所以才開發EXFAT格式來解決這些問題。
exFAT檔案系統優點：分割槽大小和單檔案大小最大可達16EB（16×1024×1024TB）；簇大小非 常靈活，最小0.5KB，最高達32MB；採用了剩餘空間分配表，空間利用率更高；同一目錄下最大檔案數可達65536個；支援訪問控制；支援 TFAT(WINCE早期檔案系統)。可以看出，ExFAT就是快閃記憶體專用的檔案系統，只有隨身碟和儲存卡才能格式化成exFAT，傳統硬碟是無法格式化成 exFAT格式的，因為exFAT的特性其實並不比NTFS強，但卻比NTFS及FAT32更適合快閃記憶體使用。
exFAT檔案系統缺點：exFAT作為一種全新的檔案系統，在電腦上的相容性卻不太好，目前主流的XP和Vista預設都不支援ExFAT，XP需升級至SP3補丁、Vista需升級至SP1補丁才能支援它。當然微軟也提供了exFAT的單獨更新檔案，Win7預設支援。
要是純論速度的話，當然是FAT最快了！
但是各檔案系統都有優劣，不僅僅是速度一個因素制約使用場景的：
一、FAT（FAT16）檔案系統
這是MS-DOS和最早期的WIN95作業系統中最常見的硬碟分割槽格式。它採用16位的檔案分配表，能支援最大為2GB的硬碟分割槽。
FAT檔案系統優點：FAT（FAT16）是目前應用最為廣泛和獲得作業系統最多的一種磁碟分割槽格式，幾乎所有的作業系統都支援這一種格式，從DOS WINDOWS95/98/NT/ME/2000/XP，甚至LINUX都支援這種分割槽格式。
FAT檔案系統缺點：最大隻支援2GB的分割槽，而且每個分割槽最多隻能有65525個簇。因此磁碟利用效率非常 低。因為在DOS和WINDOWS系統中，磁碟檔案的分配是以簇為單位的，一個簇只分配給一個檔案使用，不管這個檔案佔用整個簇容量的多少。這樣，即使一 個檔案很小的話，它也要佔用一個簇，剩餘的空間便全部閒置在那裡，形成了磁碟空間的浪費。由於分割槽表容量的限制，FAT的分割槽越大，磁碟上每個簇的容量也 越大，造成的浪費也越大。
FAT檔案系統，目前除了一些特殊應用之外，基本上已經不再使用了。試想下，目前主流的硬碟容量已經達到1TB（1TB=1024GB）了，假如使用FAT格式的話，每個分割槽最大隻能2GB，那麼電腦裡面會有多少個碟符呀！
二、FAT32檔案系統
相信大家對FAT32檔案系統不會太陌生，畢竟從Win98開始，FAT32就已經的到了廣泛的應用。FAT32格式採用32位的檔案分配表，使其對磁碟 的能力大大增強，突破了FAT16對每一個分割槽的容量只有2GB的限制。Win95以上的作業系統都支援FAT32格式。
FAT32檔案系統優點：突破了FAT對每一個分割槽的容量只有2GB的限制，可以支援大到2TB（2048G）的分割槽。在不超過8GB的分割槽容量下，每個簇的容量都固定為4KB，與FAT16相比，可以大大減少磁碟的浪費，提高磁碟利用率。
FAT32檔案系統缺點：用 FAT32格式分割槽的磁碟，由於檔案分配表的擴大，執行速度比採用FAT16格式分割槽的磁碟要慢，且DOS系統和某些早期的應用軟體不支援這種分割槽格式。 另外還有一個致命的缺點讓FAT32逐漸被淘汰，這就是FAT32的單個檔案最大隻能支援4GB。現在已經進入高畫質時代，720P和1080P高畫質影片文 件都很容易超過4GB，因此FAT32已經走向沒落。
三、NTFS檔案系統
NTFS是從Windows XP系統開始逐漸成為主流的磁碟格式，是微軟Windows NT核心的系列作業系統支援的、一個特別為網路和磁碟配額、檔案加密等管理安全特性設計的磁碟格式。支援NTFS磁碟格式的作業系統有：WINDOWS NT、WINDOWS2000、WINDOWS2003、WINDOWS XP、WINDOWS vista、WINDOWS7等。因此NTFS目前仍是主流的磁碟格式，有大量使用者在使用。
NTFS檔案系統優點：NTFS分割槽具有極高的安全性和穩定性，在使用中不易產生檔案碎片。它能對使用者的操作 進行記錄，透過對使用者許可權進行非常嚴格的限制，使每個使用者只能按照系統賦予的許可權進行操作，充分保護了系統與資料的安全。另外對大部分使用者而言，NTFS 最直觀的優點是，單個檔案的大小突破了FAT32的4GB的限制。
NTFS檔案系統缺點：NTFS雖然有諸多優點，但這些都是針對傳統機械硬碟而設計的，對於新興的Flash 快閃記憶體材料不一定適用。NTFS分割槽是採用“日誌式”的檔案系統，因為要記錄磁碟的詳細讀寫操作，對隨身碟這種快閃記憶體儲介質會造成較大的負擔，比如同樣存取一個 檔案或目錄，在NTFS系統上的讀寫次數就會比FAT32來得多，理論上NTFS格式的隨身碟比較容易損壞，而且400MB以下的分割槽也比FAT16更浪費 空間。
四、exFAT檔案系統
exFAT是近年才出現的格式，主要針對移動儲存裝置，什麼快閃記憶體、隨身碟等。因為FAT32格式單個檔案不能超過4G，使用NTFS格式又容易損壞快閃記憶體晶片，所以才開發EXFAT格式來解決這些問題。
exFAT檔案系統優點：分割槽大小和單檔案大小最大可達16EB（16×1024×1024TB）；簇大小非 常靈活，最小0.5KB，最高達32MB；採用了剩餘空間分配表，空間利用率更高；同一目錄下最大檔案數可達65536個；支援訪問控制；支援 TFAT(WINCE早期檔案系統)。可以看出，ExFAT就是快閃記憶體專用的檔案系統，只有隨身碟和儲存卡才能格式化成exFAT，傳統硬碟是無法格式化成 exFAT格式的，因為exFAT的特性其實並不比NTFS強，但卻比NTFS及FAT32更適合快閃記憶體使用。
exFAT檔案系統缺點：exFAT作為一種全新的檔案系統，在電腦上的相容性卻不太好，目前主流的XP和Vista預設都不支援ExFAT，XP需升級至SP3補丁、Vista需升級至SP1補丁才能支援它。當然微軟也提供了exFAT的單獨更新檔案，Win7預設支援。