佛珠可分為三個種類，即持珠、佩珠、掛珠，而一般的唸佛者，大多選用持珠。
持珠的姿勢，亦可分為二種，單手持珠與雙手持。單手持珠，大多用於站立、經行的時候；而雙手持珠則是打坐時經常採用的姿勢。其方法是將佛珠置於兩手之間，呈交叉狀，把母珠放在一側，掐捻一週，回至原處即可。其實，根據《佛像圖鑑》一書記載，歷來大德高僧手持佛珠的姿勢皆無定法，左手、右手、單手、雙手、提高、垂下、平胸、齊膝，各種動作都有，但求其“方便”而已，所以我們也就不必強求特定的持珠方法了。
在持珠的過程中，經常有人會遇到要不要跨過“佛頭”(母珠)這類問題。因為在經典中曾有：
珠表菩薩之勝果，於中間絕為斷漏。
繩線貫串表觀音，母珠以表無量壽。
慎莫驀過越法罪，皆由念珠積功德。
經有記載，故而才有此一說。假如唸誦者，純以佛珠作為記數的工具，則不必把母珠和隔珠計算在內，唸誦時輕輕捻過便是。如是念誦的人，除了把佛珠當作精進、記數的工具外，還希望藉著它來體悟更多佛理的話，當手捏到隔珠的時候，可用“佛、法、僧”三寶，或“戒、定、慧”三學來觀想，當手掐到母珠的時候，也同樣可以觀想佛的相好光明，同時再逆時針朝相反方向捏念，即可解決此類問題了。
佛珠除了拿在手中起唸誦記數的作用以外，還可以掛在頸部充當掛珠，或纏繞在手臂上起到佩珠的作用，這些都是具有深刻含義的：
二手持珠當心上，靜慮離念心專注，
本尊瑜伽心一境，皆得成就理事法。
設安頂髻或掛身，或安頸上及安臂，
所說言論成唸誦，以此唸誦淨三業。
由安頂髻淨無間，由帶頸上淨四重，
手持臂上除眾罪，能令行人速清淨。
若修真言陀羅尼，念諸如來菩薩名，
當獲無量勝功德，所求勝願皆成就。
再者，密教中由於三部(胎藏界)、五部(金剛界)修法之不同，對於佛珠也有著特殊的要求，與平時常用的佛珠相比，是有所不同的。據《蘇悉地羯羅經》說：“佛部用菩提子珠，觀音部用蓮花子珠，金剛部用嚕椰羅叉子珠。”又據《守護經》及《瑜伽念珠經》說：“佛部用菩提子珠，金剛部用金剛子珠，寶部用金等諸寶珠，蓮花部用蓮花子珠，羯磨部用種種和合珠。”又近人金安一居士所著《密宗輯要》一文說：“修增法用琥珀珠，修息法用水晶珠，修壞法及長壽法用珊瑚珠，修誅法用人頭骨珠，修觀音法用菩提子珠，修一切法均可用鳳眼菩提子珠。”
另外，密教的經典對掐捻佛珠的指法也有詳細規定。從五部而言，《攝真實經》中記載：佛部以右手拇指與食指掐之，金剛部以右手拇指與中指，寶部以右手拇指與無名指，蓮花部以右手拇指與小指，羯磨部以右手拇指與其餘四指合捻之。從三部而言，《蘇悉地經》中記載：佛部以右手拇指與其餘四指的指尖相合，中指與小指直立，食指略屈附於中指中節以掐之；蓮花部以拇指與中指指尖相合，舒展其餘三指而掐之；金剛部以拇指與食指指尖相合，舒展其餘三指而掐之。
佛珠可分為三個種類，即持珠、佩珠、掛珠，而一般的唸佛者，大多選用持珠。
持珠的姿勢，亦可分為二種，單手持珠與雙手持。單手持珠，大多用於站立、經行的時候；而雙手持珠則是打坐時經常採用的姿勢。其方法是將佛珠置於兩手之間，呈交叉狀，把母珠放在一側，掐捻一週，回至原處即可。其實，根據《佛像圖鑑》一書記載，歷來大德高僧手持佛珠的姿勢皆無定法，左手、右手、單手、雙手、提高、垂下、平胸、齊膝，各種動作都有，但求其“方便”而已，所以我們也就不必強求特定的持珠方法了。
在持珠的過程中，經常有人會遇到要不要跨過“佛頭”(母珠)這類問題。因為在經典中曾有：
珠表菩薩之勝果，於中間絕為斷漏。
繩線貫串表觀音，母珠以表無量壽。
慎莫驀過越法罪，皆由念珠積功德。
經有記載，故而才有此一說。假如唸誦者，純以佛珠作為記數的工具，則不必把母珠和隔珠計算在內，唸誦時輕輕捻過便是。如是念誦的人，除了把佛珠當作精進、記數的工具外，還希望藉著它來體悟更多佛理的話，當手捏到隔珠的時候，可用“佛、法、僧”三寶，或“戒、定、慧”三學來觀想，當手掐到母珠的時候，也同樣可以觀想佛的相好光明，同時再逆時針朝相反方向捏念，即可解決此類問題了。
佛珠除了拿在手中起唸誦記數的作用以外，還可以掛在頸部充當掛珠，或纏繞在手臂上起到佩珠的作用，這些都是具有深刻含義的：
二手持珠當心上，靜慮離念心專注，
本尊瑜伽心一境，皆得成就理事法。
設安頂髻或掛身，或安頸上及安臂，
所說言論成唸誦，以此唸誦淨三業。
由安頂髻淨無間，由帶頸上淨四重，
手持臂上除眾罪，能令行人速清淨。
若修真言陀羅尼，念諸如來菩薩名，
當獲無量勝功德，所求勝願皆成就。
再者，密教中由於三部(胎藏界)、五部(金剛界)修法之不同，對於佛珠也有著特殊的要求，與平時常用的佛珠相比，是有所不同的。據《蘇悉地羯羅經》說：“佛部用菩提子珠，觀音部用蓮花子珠，金剛部用嚕椰羅叉子珠。”又據《守護經》及《瑜伽念珠經》說：“佛部用菩提子珠，金剛部用金剛子珠，寶部用金等諸寶珠，蓮花部用蓮花子珠，羯磨部用種種和合珠。”又近人金安一居士所著《密宗輯要》一文說：“修增法用琥珀珠，修息法用水晶珠，修壞法及長壽法用珊瑚珠，修誅法用人頭骨珠，修觀音法用菩提子珠，修一切法均可用鳳眼菩提子珠。”
另外，密教的經典對掐捻佛珠的指法也有詳細規定。從五部而言，《攝真實經》中記載：佛部以右手拇指與食指掐之，金剛部以右手拇指與中指，寶部以右手拇指與無名指，蓮花部以右手拇指與小指，羯磨部以右手拇指與其餘四指合捻之。從三部而言，《蘇悉地經》中記載：佛部以右手拇指與其餘四指的指尖相合，中指與小指直立，食指略屈附於中指中節以掐之；蓮花部以拇指與中指指尖相合，舒展其餘三指而掐之；金剛部以拇指與食指指尖相合，舒展其餘三指而掐之。