控股子公司合併財務報表應當依據母公司在購置日設定的備查簿中登出的該子公司有關可識別資產、負債的價值，對子公司的財務報表調整，使子公司的財務報表為在購置合理價值上肯定的可識別資產、負債等在本期資產負債表日應有的數目。

由於母公司對子公司長期股權投資採用成本法進行核算，為了便於編制合併財務報表，還需要將對子公司的長期股權投資按成本法核算的結果，調整為權益法下的結果。

透過編制合併抵銷分錄，將母公司對子公司長期股權投資與子公司所有者權益，以及其他內部交易對個別財務報表的影響予以抵銷。最後，在編制合併工作底稿的基礎上，編制合併財務報表。

編制合併報表的程式：

1、檢查並調整母、子公司會計報表中可能存在的誤差和遺漏。

2、抵消企業集團內部交易的未實現損益。

3、抵消子公司因實現淨利潤而提取的法定盈餘公積、法定公益金和任意盈餘公積。

4、抵消母公司從子公司取得的投資收益和收到的股利，並將母公司對子公司股權投資賬戶餘額調整至期初數。

5、抵消年初母公司對於子公司股權投資賬戶和子公司所有者權益各賬戶的餘額，並將兩者的差額確認為合併價差；若有少數股權，還要確認相應部分的少數股東權益。

6、將合併價差分解為子公司淨資產公允價值與賬面價值的差額和商譽，並在其有效年限內加以分配和攤銷。中國《合併會計報表暫行規定》對合並價差不作選擇的分解、分配和攤銷，而是直接列於合併資產負債表中的“”長期投資“”薦下。

7、若有少數股權，在合併工作底稿上確立當年屬於少數股東的子公司淨利潤，應相應增加少數股東權益。

8、抵消母、子公司間的應收應付等往來專案。會計電算化條件下，使用者根據事並會計報表的要求，定義好合並會計報表的有關條件，軟體根據定義時設計的資料傳遞、資料計算公式等自動完成合並會計報表工作。