方法如下：

1、患者需要去住院醫院在原始發票的影印件上註明“此件與原件相符”，並加蓋醫院公章。

2、如果患者在外地打工，還得到打工所在地的醫療保險機構開證明，證明患者未在當地報銷過醫療費，未在外地打工則不需要。

3、患者還需要去縣職工醫保中心開證明，證明未在該中心報銷醫療費用。因為，現在各家保險之間並未聯網，患者是否在別處報銷過醫療費，新農合無法查詢到，所以，只能要求患者去開證明，這就是為了防止參保人重複報銷醫療費用。

4、回戶籍所在地鄉鎮定點醫療機構合作醫療結報視窗辦理報銷補償的。原則上沒有住院原始發票，只有發票影印件，是不能報銷的。參保人說醫療發票丟失，也有可能並沒有丟失，而是用於在其他醫療保險機構報銷了醫藥費。已獲其他基本醫療保險補償的醫藥費用，合作醫療不再予以報銷。

擴充套件資料

門診補償

(1)村衛生室及村中心衛生室就診報銷60%，每次就診處方藥費限額10元，衛生院醫生臨時補液處方藥費限額50元。

(2)鎮衛生院就診報銷40%，每次就診各項檢查費及手術費限額50元，處方藥費限額100元。

(3)二級醫院就診報銷30%，每次就診各項檢查費及手術費限額50元，處方藥費限額200元。

(4)三級醫院就診報銷20%，每次就診各項檢查費及手術費限額50元，處方藥費限額200元。

參考資料

安徽日報-丟失醫療發票 新農合如何報銷？