（一）稽核竣工結算編制依據編制依據主要包括：工程竣工報告、竣工圖及竣工驗收單；工程施工合同或施工協議書；施工圖預算或招標投標工程的合同標價；設計交底及圖紙會審記錄資料；設計變更通知單及現場施工變更記錄；經建設單位簽證認可的施工技術措施、技術核定單；預算外各種施工簽證或施工記錄；合同中規定的定額，材料預算價格，構件、成品價格；國家或地區新頒發的有關規定。

審計時要稽核編制依據是否符合國家有關規定，資料是否齊全，手續是否完備，對遺留問題處理是否合規。（二）稽核工程量工程量是決定工程造價的主要因素，核定施工工程量是工程竣工結算審計的關鍵。審計的方法可以根據施工單位編制的竣工結算中的工程量計算表，對照圖紙尺寸進行計算來稽核，也可以依據圖紙重新編制工程量計算表進行審計。一是要重點稽核投資比例較大的分項工程，如基礎工程、混凝土鋼筋混凝土工程、鋼結構以及高階裝飾專案等。二是要重點稽核容易混淆或出漏洞的專案。如土石方分部中的基礎土方，清單計價中按基礎詳圖的介面面積乘以對應長度計算，不考慮放坡、工作面。三是要重點稽核容易重複列項的專案。如水錶、衛生器具的閥門已計含在相應的專案中，閥門不能再列項計算安裝工程量。四是重點稽核容易重複計算的專案。如鋼筋混凝土基礎T型交接計算，梁、板、柱交接處受力筋重複計算等。對於無圖紙的專案要深入現場核實，必要時可採用現場丈量實測的方法。（三）稽核分部分項工程、措施專案清單計價一是稽核結算所列專案的合理性。注意由於清單計價招標中漏項、設計變更、工程洽商紀要等發生的高估冒算、弄虛作假問題；工程專案、工作內容、專案特徵、計算單位是否與清單計算規則相符，是否有重複內容；重點稽核價高、工程量較大或子目容易混淆的專案，保證工程造價準確。二是稽核綜合單價的正確性。除合同另有約定外，由於設計變更引起工程量增減的部分，屬於合同約定幅度以內的，應執行原有的綜合單價；工程量清單漏項或由於設計變更引起新的工程量清單專案、設計變更增減的工程量屬於合同約定幅度以外的其相應綜合單價由承包方提出，經發包人確認後作為結算的依據。審計時以當地的預算定額確定的人工、材料、機械臺班消耗量為最高控制線，參考當地建築市場人、材、機價格，根據施工企業報價合理確定綜合單價。三是稽核計算的準確性。計算公式的數字運算是否正確，是否有故意計算、合計錯誤以及筆誤等等。（四）稽核變更及隱蔽工程的簽證一是對工程變更，首先要核查原施工圖的設計、圖紙答疑和原投標預算書的實際所列專案等資料是否有出入，對原投標預算書中未做的專案要予以取消；其次核增變更中的專案。二是變更增加的專案是否已包括在原有專案的工作內容中，以防止重複計算。三是變更籤證的手續是否齊全，書寫內容是否清楚、合理。含糊不清和缺少實質性內容的要深入現場核查並向現場當事人進行了解，核查後加以核定。（五）稽核規費、稅金及其他費用一是審計費率計算是否正確，計算基礎是否符合規定，有無錯套費率等級情況；二是稽核費率的採用是否正確；三是審查各項獨立費的計取是否正確。（六）稽核施工企業資質嚴格稽核施工企業的資質，對掛靠、無資質等級及無取費證書的施工企業，應降低綜合單價或審計確定綜合單價及造價。（七）稽核工程合同工程合同審計是投資審計的一項重要內容，必須仔細查閱相關檔案資料是否齊全、合法合規。