這個問題比較複雜，並不是如樓主認為的那麼簡單。

變性人在醫學上被稱之為性別認同障礙或性別煩躁，主要表現為就是對由於自我認知或者表達的性別與生理性別不一致而產生的焦慮或苦惱。

雖然是病，但卻允許做變性手術。

這是因為這種疾病的問題僅是由對性別不滿而造成的，如果將性別更改，患者就能如常人一樣正常生活、工作、社交等等。因此如果患者的變性意願十分強烈，最重要的是沒有其他精神、心理、軀體或社會問題等因素影響，透過專業的醫學、法律等相應評估，就可以為其進行手術或激素治療。

目前中國可以為其開具允許變性證明的醫療機構為北京大學第六醫院、上海精神衛生中心等專業精神病醫院。相對來說，各地區的省級、市級精神衛生專業醫院很少會為患者開具這樣的證明，這是因為其中牽涉的醫療評估及診斷水平較高，加之作出變性決定對於患者和醫生來說不是一件容易的事情，所以需要謹慎對待。

在臨床上有一些患者在變性後往往會出現適應不良，並後悔變性的決定，為此造成的精神問題也不少見。所以很難說變性與否就是心理健康的標誌，具體問題需要具體分析。