主要區別是，性質不同、過程不同、設定地點不同，具體如下：

一、性質不同

1、垃圾收集

垃圾收集，是生活垃圾從被投放開始，經收集到被運至中轉站或處理場的過程。

2、垃圾轉運站

是在垃圾產地（或集中地點）至處理廠之間所設的垃圾中轉站。

二、過程不同

1、垃圾收集

混合收集主要有三種方式，一是將收集容器放置於固定的地點，如居民小區、街道兩側，以及其他公共場所。每天有專門的環衛人員負責收集這些容器裡的垃圾。二是在居民小區建有固定的垃圾收集站，居民每天可以把生活垃圾扔到垃圾站。三是垃圾道，在高層住宅樓中，垃圾道在建樓時就已經設計好了，從一層一直直通到頂層，居民可以把垃圾扔進垃圾道，環衛人員從底層拿走。

2、垃圾轉運站

收集到的垃圾由專門的垃圾車運到垃圾轉運站。垃圾被運到轉運站後要進行第一步處理。首先由分類機進行分類，被分為有機物和無機物，以及可利用的和不可利用的。對於大體積的垃圾還要進行壓縮處理。之後，這些垃圾被分類運走。

三、設定地點不同

1、垃圾收集

主要在居民區、商業區等城區範圍內。

2、垃圾轉運站

轉運站的選址應符合城市總體規劃和城市環境衛生行業規劃的要求，轉運站的位置宜選在靠近服務區域的中心或垃圾產量最多的地方，交通方便的地方。在具有鐵路及水運便利條件的地方，當運輸距離較遠時，宜設定鐵路及水路運輸垃圾轉運站。