《四庫全書》的內容是十分豐富的。按照內容分類分經、史、子、集四部分，部下有類，類下有屬。全書共4部44類66屬。

經部收錄儒家“十三經”及相關著作，包括易類、書類、詩類、禮類、春秋類、孝經類、五經總義類、四書類、樂類、小學類等10個大類，其中禮類又分周禮、儀禮、禮記、三禮總義、通禮、雜禮書6屬，小學類又分訓詁、字書、韻書3屬。

史部收錄史書，包括正史類、編年類、紀事本末類、雜史類、別史類、詔令奏議類、傳記類、史鈔類、載記類、時令類、地理類、職官類、政書類、目錄類、史評類等15個大類，其中詔令奏議類又分詔令、奏議2屬，傳記類又分聖賢、名人、總錄、雜錄、別錄5屬。

子部收錄諸子百家著作和類書，包括儒家類、兵家類、法家類、農家類、醫家類、天文演算法類、術數類、藝術類、譜錄類、雜家類、類書類、小說家類、釋家類、道家類等14大類，其中天文演算法類又分推步、算書2屬，術數類又分數學、佔侯、相宅相墓、占卜、命書相書、陰陽五行、雜技術7屬，藝術類又分書畫、琴譜、篆刻、雜技4屬。

集部收錄詩文詞總集和專集等，包括楚辭、別集、總集、詩文評、詞曲等5個大類，其中詞曲類又分詞集、詞選、詞話、詞譜詞韻、南北曲5屬。

除了章回小說、戲劇著作之外，以上門類基本上包括了社會上流佈的各種圖書。就著者而言，包括婦女，僧人、道家、宦官、軍人、帝王、外華人等在內的各類人物。