生物鹼鹼性大小可以透過以下五種方式來比較。
1）氮原子的雜化方式 氮原子雜化程度的升高,鹼性增強,即sp3＞sp2＞sp.如四氫異喹啉（pKa9.5）為sp3雜化；吡啶（pKa5.17）和異喹啉（pKa5.4）均為sp2雜化；氰基呈中性,因其為sp雜化.季銨鹼的鹼性強（pKa11.5以上）則是因羥基以負離子形式存在,類似無機鹼.
2）誘導效應 生物鹼分子中的氮原子上的電子雲密度可受氮原子附近供電基（如烷基）或／和吸電基（如各類含氧基團、芳環、雙鍵）誘導效應的影響.供電誘導使氮原子上電子雲密度增加,鹼性增強；吸電誘導使氮原子上電子雲密度減小,鹼性降低.如麻黃鹼的鹼性強於去甲麻黃鹼,即是由於麻黃鹼氮原子上的甲基供電誘導的結果.而二者的鹼性弱於苯異丙胺,則因前二者氨基碳原子的鄰位碳上羥基吸電誘導的結果.
3）共軛效應 ①苯胺型：氮原子上的孤電子對與苯環π-電子形成p-π共軛體系後鹼性減弱.如毒扁豆鹼的兩個氮原子鹼性的差別系由共軛效應引起.②醯胺型：醯胺中的氮原子與羰基形成p-π共軛效應,使其鹼性極弱.如胡椒鹼秋水仙鹼、咖啡因.③胍類：胍接受質子後形成季銨離子,呈更強的p-π共軛,體系具有高度共振穩定性,而顯強鹼性.
4）空間效應 氮原子由於附近取代基的空間立體障礙或分子構象因素,而使質子難於接近氮原子,鹼性減弱.如東莨菪鹼、利血平等.
5）氫鍵效應 當生物鹼成鹽後,氮原子附近如有羥基、羰基,並處於有利於形成穩定的共軛酸分子內氫鍵時,氮上的質子不易離去,則鹼性強.如10-羥基可待因.一般來說,空間效應與誘導效應共存,空間效應居主導地位；共軛效應與誘導效應共存,共軛效應居主導地位
生物鹼鹼性大小可以透過以下五種方式來比較。
1）氮原子的雜化方式 氮原子雜化程度的升高,鹼性增強,即sp3＞sp2＞sp.如四氫異喹啉（pKa9.5）為sp3雜化；吡啶（pKa5.17）和異喹啉（pKa5.4）均為sp2雜化；氰基呈中性,因其為sp雜化.季銨鹼的鹼性強（pKa11.5以上）則是因羥基以負離子形式存在,類似無機鹼.
2）誘導效應 生物鹼分子中的氮原子上的電子雲密度可受氮原子附近供電基（如烷基）或／和吸電基（如各類含氧基團、芳環、雙鍵）誘導效應的影響.供電誘導使氮原子上電子雲密度增加,鹼性增強；吸電誘導使氮原子上電子雲密度減小,鹼性降低.如麻黃鹼的鹼性強於去甲麻黃鹼,即是由於麻黃鹼氮原子上的甲基供電誘導的結果.而二者的鹼性弱於苯異丙胺,則因前二者氨基碳原子的鄰位碳上羥基吸電誘導的結果.
3）共軛效應 ①苯胺型：氮原子上的孤電子對與苯環π-電子形成p-π共軛體系後鹼性減弱.如毒扁豆鹼的兩個氮原子鹼性的差別系由共軛效應引起.②醯胺型：醯胺中的氮原子與羰基形成p-π共軛效應,使其鹼性極弱.如胡椒鹼秋水仙鹼、咖啡因.③胍類：胍接受質子後形成季銨離子,呈更強的p-π共軛,體系具有高度共振穩定性,而顯強鹼性.
4）空間效應 氮原子由於附近取代基的空間立體障礙或分子構象因素,而使質子難於接近氮原子,鹼性減弱.如東莨菪鹼、利血平等.
5）氫鍵效應 當生物鹼成鹽後,氮原子附近如有羥基、羰基,並處於有利於形成穩定的共軛酸分子內氫鍵時,氮上的質子不易離去,則鹼性強.如10-羥基可待因.一般來說,空間效應與誘導效應共存,空間效應居主導地位；共軛效應與誘導效應共存,共軛效應居主導地位