已經認證抵扣的增值稅專用發票，需要開具紅字發票的，必須由購買方向國稅局發起開具紅字發票的申請，並將抵扣的增值稅額做進項稅額轉出處理，等國稅局批准後，由銷售方開具紅字增值稅專用發票。

開了紅字發票，銷售方要根據紅字發票的記賬聯，做與原來分錄一致的負數或紅字分錄進行衝減。

借：銀行存款/應收賬款 負數或紅字

貸：主營業務收入 負數或紅字

貸：應交稅費--應交增值稅(銷項稅額) 負數或紅字

購貨方應該做進項稅額轉出

借：原材料/庫存商品 負數或紅字

借：應交稅費--應交增值稅--進項稅額轉出 負數或紅字

貸：應付賬款 負數或紅字

擴充套件資料

已經認證抵扣的增值稅發票開紅字發票後賬務處理：

（1）、銷售方開具紅字專票時，衝減前期已確認的收入和銷項稅額。

（2）、銷售方開具藍字專票時，根據藍字專票在當期確認收入和銷項稅額。

（3）、購買方根據《開具紅字增值稅專用發票資訊表》，衝減前期已確認的採購成本，同時作進項稅額轉出；取得紅字專票後，將其作為衝減分錄的附件。

（4）、購買方取得藍字專票後，根據藍字專票在當期確認採購成本和「待認證進項稅額」（進項稅額）。

根據國家稅務總局公告2016年第47號檔案相關規定，購買方取得專用發票已用於申報抵扣，發現開票有誤，且不符合作廢條件的，按規定先開紅票，再開藍票。購買方可在增值稅發票管理新系統（以下簡稱新系統）中填開並上傳《開具紅字增值稅專用發票資訊表》（以下簡稱《資訊表》），在填開《資訊表》時不填寫相對應的藍字專用發票資訊，應暫依《資訊表》所列增值稅稅額從當期進項稅額中轉出，待取得銷售方開具的紅字專用發票後，與《資訊表》一併作為記賬憑證。