有機物命名時基團的順序是：

1、將單原子取代基按原子序數(atomic number)大小排列，原子序數大的順序在前，原子序數小的順序在後，有機化合物中常見的元素順序如下：I>Br>Cl>S>P>F>O>N>C>D>H，在同位素(isotope)中質量高的順序在前。

2、如果兩個多原子基團的第一個原子相同，則比較與它相連的其它原子，比較時，按原子序 數排列，先比較最大的，仍相同，再順序比較居中的、最小的。

3、含有雙鍵或三鍵的基團，可認為連有兩個或三個相同的原子。

4、若參與比較順序的原子的鍵不到4個，則可以補充適量的原子序數為零的假想原子，假想原子的排序放在最後。

擴充套件資料：

有機物命名主鏈或主環系的選取

以含有主要官能團的最長碳鏈作為主鏈，靠近該官能團的一端標為1號碳。如果化合物的核心是一個環（系），那麼該環系看作母體；除苯環以外，各個環系按照自己的規則確定1號碳，但同時要保證取代基的位置號最小。支鏈中與主鏈相連的一個碳原子標為1號碳。

數詞規則：位置號用阿拉伯數字表示。官能團的數目用漢字數字表示。碳鏈上碳原子的數目，10以內用天干表示，10以外用漢字數字表示。

雜環化合物：把雜環看作碳環中碳原子被雜原子替換而形成的環，稱為“某雜（環的名稱）”；（如：氧雜環戊烷） 給雜原子編號，使雜原子的位置號儘量小。 其他官能團視為取代基。