清朝的總督和提督的差別很大，從地位上來說，總督是封疆大吏，是一省或數省的軍政最高長官，而提督只是軍官，是一省的綠營兵的軍事主官，他是隻是一個省的軍事主官，即負責帶兵打仗的，但不是軍隊的統帥，軍隊的統帥是總督。提督是帶兵官，不是統兵官。

清代的定製，總督為文官從一品，並按慣例有“兵部尚書兼右都御史”的加銜，因此總督的職權是“掌治軍民，綜制文武”。所以說總督是一省或數省的軍政最高長官。

提督在清代的定製，是武官的從一品，從品級上看跟總督好像差不多，但文官之間，差別就大了，因為武將做到提督就到頭了，提督就是武將的天花板了。所以在官場，提督的地位那怕跟總督的品級一樣，也要矮人一截。因為提督中介類似於專業技術人員，不是真正意義上的“官”。提督的職權是“掌鞏護疆陲，典領甲卒，節制鎭、協、營、汛，課第殿最，以聽於總督”，提督實際上就是帶著兵聽總督的命令做事的，簡單地說，提督雖然有兵，但無兵權，兵權在總督手上。

我們舉個例子來理解一下。鴉片戰爭中，定海失守之後，朝廷對於收復定海的安排是廷寄諭旨給閩浙總督鄧廷楨，原話是：

著鄧廷楨選派閩省大員，帶領舟師，星飛赴浙，無論夷船在於何處，卽會同浙江水師合兵會剿等因。欽此。

可以清楚地看到，地方軍務的負責人是總督不是提督，中央對地方軍事問題的決策是由總督去負責執行。鄧廷楨接到朝廷的諭旨後，先是將本省兵馬集結，然後又命人去招募士兵組建援浙軍，可以說執行朝廷的軍事決策的是總督，那麼這時的提督餘步雲是在幹什麼呢？

餘步雲對於援浙軍事，基本上沒權過問，只是等到福建方面的軍隊集結完畢後，鄧廷楨下令讓福建提督餘步雲帶兵前去浙江增援，這時餘步去才有事可做，朝廷的諭旨中讓鄧廷楨“選派閩省大員”去浙江增援，而鄧廷楨選派就是提督餘步雲，所以決定提督帶什麼兵去哪裡打仗，是由總督決定的。同時因為餘步雲帶兵赴浙，鄧廷楨在徵求了餘步雲的意見後，委任建寧總兵曾大觀出任代理提督之職。可見總督不但有權指揮提督，還對提督的職務也有人事任免權。

上面這個例子中，餘步雲身為提督，是武將，所以要負責去帶兵打仗，但是他沒有兵權，無權決定到那裡去打仗，以及打什麼兵去打仗，這些事情都是由總督根據朝廷的旨意來決定的，同時總督雖然有兵權，但他們不能直接去帶兵，因為總督是文官，沒有能力親自上戰場上去指揮士兵作戰的。