1.企業的扣繳義務是法定的。個人所得稅以所得人為納稅義務人，以支付所得的單位或者個人為扣繳義務人，這是個人所得稅法法定的。

2.個人特殊情況下是可以自行申報繳納的。個人所得超過國務院規定數額的，在兩處以上取得工資、薪金所得或者沒有扣繳義務人的，以及具有國務院規定的其他情形的，納稅義務人應當按照國家規定辦理納稅申報。這也是個人所得稅法法定的。

3.稅不重徵。如果企業對個人支付款項，個人向稅務部門繳納了個人所得稅，並取得了完稅證明，企業不能再扣繳。

4.如果個人是由於上述特殊情況自行申報納稅的，企業就沒有扣繳義務。如果個人是由於其他原因造成自行申報納稅的，一般情況下，稅務部門不受理。企業扣繳個人所得稅的義務不變。

企業負有代扣代繳義務！

只要是稅法規定的情形都負有代扣代繳義務。

根據《個人所得稅全員全額扣繳申報管理暫行辦法》（國稅發〔2005〕205號）第四條的規定： 實行個人所得稅全員全額扣繳申報的應稅所得包括： 　　

（一）工資、薪金所得； 　　

（二）勞務報酬所得； 　　

（三）稿酬所得； 　　

（四）特許權使用費所得； 　　

（五）利息、股息、紅利所得； 　　

（六）財產租賃所得； 　　

（七）財產轉讓所得； 　　

（八）偶然所得； 　　

（九）經國務院財政部門確定徵稅的其他所得。

屬於以上九種情況應當代扣代繳。

另外，根據提問再結合實務中，個人在稅務局繳納個人所得稅估計應該是去稅務機關代開增值稅發票。個人代開發票徵收個人所得稅一般是按1.5%（各地有差異）繳納。企業應當按照法定稅率和已繳納稅率差補代扣代繳個稅，否則存在稅收風險。

可能面臨將面臨被處應扣未扣、應收未收稅款百分之五十以上三倍以下的罰款。