空空導彈在理論上是可以攔截導彈的，但在攔截彈道導彈時比較困難一些，比如在探測跟蹤上需要預警衛星玫預警飛機的配合，其次是彈道導彈只有在進入到末端才能夠被空空導彈的射程所攔截，而彈道導彈進入到末端之時，也是速度最快的時候，慢一點也能達到十馬赫。如果沒有預警飛機朝代導彈的彈道進行提前量的攔截，基本不可能被攔截。

還有目前被大國鐵了心要研製的高超音束武器，這個是空空導彈完全沒有能力攔截的，就是目前世界上所有的導彈攔截系統都沒有能力攔截。除非以後鐳射武器的研製有了突破。

巡航導彈，比如美國的戰斧，俄羅斯的口徑。中國的長劍。這些都是高亞音速的巡航導彈，飛行速度慢，在被雷達系統發現目標後，在防空導彈的射程以外時，是可以被空空導彈所攔截的，這也是空空導彈攔截機率最高的導彈了。

世界上現在成熟攔截巡航導彈一般有三種方法：陸基、海基還有空中。但是現在最成熟的還是陸基攔截！據報道前些年美國陸軍和空軍聯手進行擊毀反艦巡航導彈的空中作戰，試驗使用了聯合地面攻擊巡航導彈防禦空中網路化感測器系統(JLENS)高空氣球雷達獲取的目標資料。此次在猶他測試訓練場進行的試驗中，JLENS捕獲並跟蹤了有威脅的目標，並使用一架F-15E戰鬥機透過Link 16傳輸了目標資料。戰鬥機發射一枚AIM-120C7先進中程空-空導彈(AMRAAM)，成功地攔截了靶彈。雷神公司稱，此次試驗達到了所有的測試目標。靶彈的詳細資料尚未公佈，但隨著先進中程空空導彈與JLENS的整合，其可以在最大的運動半徑作戰。JLENS已經證明其可以透過與愛國者、標準-6和AMRAAM導彈整合來並完成防禦及擴大作戰範圍， 此次試驗提高了巡航導彈的防禦範圍。JLENS由兩個裝備有S波段(2-4GHZ)監視雷達和其他X波段(8-12GHz的)火控雷達的留空高空氣球組成。JLENS的認證測試應該於9月底完成。該系統將部署在馬里蘭州的阿伯丁試驗場進行軍隊的作戰測試。在此之前，人員培訓將在猶他進行。(專業訊息來自中國航天系統科學與工程研究院 )