扁形動物有的有專門的運動器官。
非寄生類的扁形動物有運動器官。如渦蟲，其腹部有纖毛，是渦蟲的基本的運動器官。
寄生類扁形動物沒有運動器官，因為跟生活相適應，寄生類扁形動物沒有專門的消化器官，運動器官和感覺器官也都退化，而生殖器官卻特別發達，如豬肉絛蟲的每個妊娠節片中含有5萬多個受精卵，因此寄生類扁形動物與寄生生活相適應的特點是消化器官很簡單而生殖器官很發達。
扁形動物的主要特徵：
兩側對稱從扁形動物開始出現了兩側對稱的體型,即透過動物體的中央軸，只有一個對稱面將動物體分成左右相等的兩部分，因此兩側對稱也稱為左右對稱。
從扁形動物開始，在外胚層和內層胚之間出現了中胚層。中胚層的出現對動物體結構與機能的進一步發展有很大意義。一方面由於中胚層的形成減輕了內、外胚層的負擔，引起了一系列組織、器官、系統的分化，為動物體結構的進一步複雜完備提供了必要的物質條件，使扁形動物達到了器官系統水平。
由於中胚層的形成而產生了複雜的肌肉構造，如環肌、縱肌、斜肌。與外胚層形成的表皮相互緊貼而組成的體壁稱為面板肌肉囊，它所形成的肌肉系統除有保護功能外，還強化了運動機能，加上兩側對稱，使動物能夠更快和更有效地去攝取食物，更有利於動物的生存和發展。
消化系統與一般腔腸動物相似，通到體外的開孔既是口又是肛門，僅單咽目渦蟲，如單咽蟲有臨時肛門，故稱為不完善消化系統。除了腸以外沒有廣大的體腔。腸是由內臟層形成的盲管，營寄生生活的種類,消化系統趨於退化或完全消失。
從扁形動物開始出現了原腎管的排洩系統。它存在於這門動物所有類群。原腎管是由身體兩側外胚層陷入形成的，通常由具許多分支的排洩管構成，有排洩孔通體外。每一小分支的最末端由焰細胞組成盲管。
扁形動物的神經系統比腔腸動物有顯著的進步。表現在神經細胞逐漸向前集中形成腦。從“腦”向後分出若干縱神經索,在縱神經索之間有橫神經相連。在高等種類，縱神經索減少，只有一對腹神經索發達，其中有橫神經連線如梯形,腦與神經索都有神經纖維與身體各部分聯絡。
生殖系統大多數雌雄同體，由於中胚層的出現，形成了產生雌雄生殖細胞的固定的生殖腺及一定的生殖導管，如輸卵管、輸精管等，以及一系列附屬腺，如前列腺、卵黃腺等。這樣使生殖細胞能通到體外, 進行交配和體內受精。
扁形動物有的有專門的運動器官。
非寄生類的扁形動物有運動器官。如渦蟲，其腹部有纖毛，是渦蟲的基本的運動器官。
寄生類扁形動物沒有運動器官，因為跟生活相適應，寄生類扁形動物沒有專門的消化器官，運動器官和感覺器官也都退化，而生殖器官卻特別發達，如豬肉絛蟲的每個妊娠節片中含有5萬多個受精卵，因此寄生類扁形動物與寄生生活相適應的特點是消化器官很簡單而生殖器官很發達。
扁形動物的主要特徵：
兩側對稱從扁形動物開始出現了兩側對稱的體型,即透過動物體的中央軸，只有一個對稱面將動物體分成左右相等的兩部分，因此兩側對稱也稱為左右對稱。
從扁形動物開始，在外胚層和內層胚之間出現了中胚層。中胚層的出現對動物體結構與機能的進一步發展有很大意義。一方面由於中胚層的形成減輕了內、外胚層的負擔，引起了一系列組織、器官、系統的分化，為動物體結構的進一步複雜完備提供了必要的物質條件，使扁形動物達到了器官系統水平。
由於中胚層的形成而產生了複雜的肌肉構造，如環肌、縱肌、斜肌。與外胚層形成的表皮相互緊貼而組成的體壁稱為面板肌肉囊，它所形成的肌肉系統除有保護功能外，還強化了運動機能，加上兩側對稱，使動物能夠更快和更有效地去攝取食物，更有利於動物的生存和發展。
消化系統與一般腔腸動物相似，通到體外的開孔既是口又是肛門，僅單咽目渦蟲，如單咽蟲有臨時肛門，故稱為不完善消化系統。除了腸以外沒有廣大的體腔。腸是由內臟層形成的盲管，營寄生生活的種類,消化系統趨於退化或完全消失。
從扁形動物開始出現了原腎管的排洩系統。它存在於這門動物所有類群。原腎管是由身體兩側外胚層陷入形成的，通常由具許多分支的排洩管構成，有排洩孔通體外。每一小分支的最末端由焰細胞組成盲管。
扁形動物的神經系統比腔腸動物有顯著的進步。表現在神經細胞逐漸向前集中形成腦。從“腦”向後分出若干縱神經索,在縱神經索之間有橫神經相連。在高等種類，縱神經索減少，只有一對腹神經索發達，其中有橫神經連線如梯形,腦與神經索都有神經纖維與身體各部分聯絡。
生殖系統大多數雌雄同體，由於中胚層的出現，形成了產生雌雄生殖細胞的固定的生殖腺及一定的生殖導管，如輸卵管、輸精管等，以及一系列附屬腺，如前列腺、卵黃腺等。這樣使生殖細胞能通到體外, 進行交配和體內受精。