具有獨立遺傳系統的環狀DNA可以複製，例如線粒體，植物細胞中的葉綠體存在於動物細胞和低等植物細胞的中心體是由微管蛋白構成，可以自己組裝。

以下是細胞器複製方式：

中心體： 這個很明確，它是隨著細胞的分裂，在染色體分離的時候同時兩個中心體也都各自產生一箇中心體，隨著染色體的分離也分開。

葉綠體和線粒體內都有基因（DNA和RNA），這些基因能夠控制它們自身的複製。

葉綠體能靠分裂而增殖，這各分裂是靠中部縊縮而實現的，在發育7天的 幼葉的基部2-2.5cm處很容易看到幼齡葉綠體呈啞鈴形狀，從菠菜幼葉含葉綠體少，ctDNA多，老葉含葉綠體多，每個葉綠體含ctDNA少的現象也可以看出葉綠體是以分裂的方式增殖的。

線粒體是半自主的細胞器，自身能合成十餘種蛋白質。線粒體的核糖體蛋白、氨醯tRNA 合成酶、許多結構蛋白， 都是核基因編碼， 在細胞質中合成後，定向轉運到線粒體的，因此稱線粒體為半自主細胞器。

增殖：線粒體的增殖是透過已有的線粒體的分裂，有以下幾種形式：

1、間壁分離，分裂時先由內膜向中心皺褶，將線粒體分類兩個，常見於鼠肝和植物產生組織中

2、收縮後分離，分裂時透過線粒體中部縊縮並向兩端不斷拉長然後分裂為兩個，見於蕨類和酵母線粒體中。

3、出芽，見於酵母和蘚類植物，線粒體出現小芽，脫落後長大，發育為線粒體。