1、區別很大，因為三方協議在在畢業生到單位報到、用人單位正式接收後自行終止。而在三方協議終止之後，公司在一個月內與畢業生簽訂勞動合同。 　　

2、但是在校大學生在校期間還未畢業時，是不適用勞動合同法的！如果你還沒畢業，這些你要跟用工單位去談的。　　實際上是沒有實習合同這種說法的，因為在校大學生實習期（也就是在校大學生的實習期）只有可能籤協議，也就是實習協議。沒有五險一金，因為你沒畢業，沒有就失業證、養老保險手冊。即便你去仲裁公司也只能是不予受理或者敗訴。 　　

3、三方就業協議書不同於勞動合同：　　首先，三方就業協議書是國家教育部統一印製的，主要是明確三方的基本情況及要求。三方就業協議書制定的依據是國家關於高校畢業生就業的法規和規定，有效期為：自簽約日起至畢業生到用人單位報到止的這一段時間。而勞動合同是受《勞動法》和《合同法》的限定和保護，有些用人單位如許多外企在確定錄用時（注：在到用人單位報到前），就同時要求和畢業生簽訂一份類似勞動合同的協議；而更多的用人單位則要求先簽“就業意向書”，畢業生報到後再簽訂勞動合同。　　其次，就業協議是三方合同，它涉及學校、用人單位、學生等三方面，三方相互關聯但彼此獨立；而勞動合同是雙方合同，它由勞動者和用人單位兩方的權利、義務構成。　　最後，畢業生簽訂就業協議時仍然是學生身份，但是簽訂勞動合同時應當是勞動者身份。勞動合同一經簽訂，就業協議的效力應當喪失。若勞動合同與三方協議附件內容矛盾，則以勞動合同為準。