但是皇太子朱標先於朱元璋離世，朱元璋最終選擇皇太子朱標留在人世中最大的兒子朱允炆為皇太孫，繼承了儲君的位子。朱元璋去世後，朱允炆便順利地繼承了皇位。成為了大明王朝第二位皇帝，隨後不久朱允炆與老臣齊泰、黃子澄等商議，認為藩王駐守一方終究會成為大明王朝的毒瘤和隱患。於是決定馬上削藩，最終逼反了燕王朱棣。

看了各種關於朱充炆生死的傳說。本人認為朱充炆沒有死。死的是朱充炆的替身，或者是乾脆朱棣幫他找了一個替身。

作為朱棣，為什麼能夠快速從北京打到南京，因為他的口號是’清君側’，朱充炆削藩，觸動的是朱家的勢力利益，也就是他自己的叔叔們及堂兄弟們及開國元勳們的利益。朱棣意思說：皇帝身邊出現小人，禍害我等，我代各位兄弟子侄大臣，去清理掉小人。神仙打架，與凡人何關？所以朱棣人馬輕鬆就到了南京。

朱棣到了南京，要做帝位，只有朱充炆死了，才能’名正言順’。假設朱充炆沒有死，朱棣殺了小人，還該恭尊大侄子當皇上。朱棣及其手下大將，必須讓朱充炆死，不死也得說死了，活著的敢出來，就是假的。

朱棣最怕是朱允炆突然冒出來，或者是朱充炆沒有死訊息走漏。這就解釋了’鄭和下西洋’、大明的’禁海令’、殺掉朱充炆妃子，這一切都是怕走漏風聲。

在這場奪權戰役中，不是建文帝死，就是朱棣死。在朱棣攻破南京城的時候，在南京城裡並沒有找到建文帝，這對於朱棣的皇位來說，無疑是一個最大的威脅。所以他‘繼承’了朱元璋的‘血性’，本著寧可所殺一千絕不放過一個。

建文帝的失蹤，對於朱棣來說，是最大的威脅。所以只要有一線能夠找到建文帝的機會，他都不會放過。歷史上任何一個皇帝都不允許自己的皇權收到威脅。

還有就是那麼多妃子裡面保不齊有懷有建文帝龍子的，這樣就是給自己留下隱患，朱棣也懼怕星星之火燎原之事。

所以建文帝的一眾妃子必須殺，雖然這些都沒有正史的記載，不過猜測有之

在明成祖晚年，則發生過兩起宮中大案，前後被誅殺的宮女有3000多人。

這兩件事國內的史書上是沒有記載的，原因很簡單，作為朱棣的後世子孫不可能把這麼丟人和殘酷的事說出來，這有損於明成祖的英明形象。記載這件事的是北韓李朝的《世宗實錄》，收集在著名歷史學家吳晗編輯的《北韓李朝實錄中的中國史料》第一冊。真實性不用懷疑。為什麼北韓的史料上會有記載呢？在宣宗和英宗時期，放還了宮中北韓籍的乳母、婢女等，這些事情才流傳出來。

首先這件事情正史中是沒有記載的，也就是說它存不存在是有點商榷的。如果真有這件事那麼理由也很簡單，只有對建文帝一脈的斬盡殺絕，避免以後可能會出現的麻煩。

當然，除了誅殺建文帝舊臣外，還有就是題主所說的屠盡建文後宮（有待商榷，就以存在這件事為真，來做分析）。

看起來不近人情，甚至有點濫殺無辜的味道，實則朱棣是為了避免以後出現這些麻煩。最後，就朱棣而言，既然能對建文帝舊臣舉起屠刀，那麼對建文帝的後宮進行清洗又有什麼不可能呢。

這個事情就被爆發在中國古代明朝時期洪武三十一年，西曆1398年，當時的明朝的開國皇帝是朱元璋，他駕崩於這個時期，他將他自己尊貴無比的皇位由他親自下旨給自己的太孫朱允效(建文帝)繼承。朱元璋在世期間，將明朝的開國功臣幾乎都對其一一進行消弱或者是將其一個個的斬殺， 當時朱元璋還在人世間的時候，就對當時還在人世的太子朱標表示，自己在為他鋪平以後他當皇帝的道路。而朱元璋還在為自己的太子鋪平到來的同時，他還把其他的妃子所生下的兒子冊封在邊關做了諸侯王。

原因有下：

1.妃子如果納入後宮，有可能會有一些懷孕的妃子，到時候有可能是朱允文的後代。

2.妃子中有可能有一些對朱允文衷心的人，會在朱棣睡覺的時候暗殺，防不勝防。

3.朱允文逃跑了，妃子後面有可能和他裡應外合奪回皇位。

綜上，朱棣不敢冒險。

朱棣誅殺後宮佳麗正史沒有記載，如果真誅殺後宮嬪妃的話，那就只有一個原因：將朱允文可能的後代殺絕，避免有人藉機謀反！

朱棣進京後，朱允文及其兩個兒子都失蹤了，有人說是被大火燒死了，有人說是出家當和尚了。不管哪種結果，對於朱棣當皇帝是有利的，因為沒有人來爭了！

朱棣殺光后妃還存在一種可能性，相當高的原因，那就是朱棣擔心發生瓜田李下的尷尬故事，由於明朝已經和唐朝大不一樣了，經過宋朝，尤其是南宋朱熹理學發展後的國家，對待名節是非常慎重的，當時的理學家們紛紛鼓吹餓死事小失節是大，朱棣很有可能擔心自己一個不小心就睡了侄子的女人，再或者侄子的后妃不甘寂寞來勾引他一波，一旦發生這種情況，所以說不會影響他的皇位穩固，但會讓他在輿論中處於不利地位。

眾所周知，朱棣的皇位是篡位得來的！他當上皇帝以後，就對宮裡的宮女進行了大換血！

其實有兩個原因：第一就是為了防止訊息外漏。朱棣知道自己的皇位來的不是那麼體面，所以殺了宮裡的宮女，防止她們將皇室祕訊息外傳，損傷皇室名譽。

　　第二就是為了斬草除根，因為宮裡的女子都屬於皇帝，萬一建文帝偷偷寵幸了哪位宮女，生下了孩子，是給自己帶來很大的麻煩。後宮複雜，所以乾脆一刀斬，徹底根除後患。

至於他為什麼先把建文帝留下來的宮中美女絞殺乾淨，就不得不承認他打的如意算盤，一來他是想借機拷問，當時建文帝的下落。

另一方面，朱棣也是想借她們之口，親耳聽到他想要的答案，只有這樣他才能夠安心的登基稱帝，殺人滅口就是最好的處理方式！

老朱的想法很好，既能夠保證將來大明朝穩定，又少了將來為了皇位兄弟相殘的局面，實力相當，相互制約反而更好。但是上天卻突然開了個玩笑，原定的太子朱標，卻先朱元璋一步而去世，兒子去世那就傳孫子唄，但是這對於朱允炆，無疑是極大的負擔。

朱允炆自知實力不濟，為了保持自己最後的尊嚴，留給朱棣的反而是大火燃燒的皇宮，以及朱允炆那不為人知的下落，最終也只有兩具形似朱允炆和他皇后的焦黑屍體。

朱元璋在世就生性多疑，朱棣無疑將這一特徵遺傳的最為明顯，父子倆同樣也嗜好殺戮，歸根結底也不過是為了自己手中的權力！