原因有很多。

首先宗教原因，整個歐洲幾乎都是基督宗教的天下（這裡的“基督宗教”指包括天主教、基督新教和東正教），而猶太人卻信仰猶太教，猶太教否認基督宗教的“三位一體”教義，不承認耶穌是彌賽亞。

其次，猶太人在兩千多年前猶太-以色列王國滅國之後，到處漂泊流浪，很多歐洲人把他們等同於吉普賽人、羅姆人等，認為是他們神秘、施巫術、行蠱且偷拐兒童的邪惡異教徒，對他們非常憎惡。

再次，由於宗教不同且猶太人恪守自己的傳統，他們很難和當地人融合（來中國的猶太人除外，在中國的猶太人幾乎完全被漢人同化、漢化，除了外貌，完全和當地漢人無異），所以他們都有自己的集聚區，和當地人非常隔閡。

由於被歧視，歐洲的猶太人不被允許擁有土地，所以他們沒法成為安定的農民，只能成為手工藝人或者商人，特別是有錢之後往往會成為放高利貸的，所以被視為精明、奸詐甚至貪婪的剝削者。（比如說莎士比亞《威尼斯商人》筆下的猶太人高利貸者形象等，在普羅大眾中深入人心）。

還有一點非常重要，就是猶太人被視作出賣和殺死耶穌的罪魁禍首，成為最大的敵基督民族，往往被基督宗教徒所憎恨。

至於猶太人在中東地區受阿拉伯民族排擠，則是在以色列建國之後。在以色列建國之前，也有很多猶太人居住在中東地區，阿拉伯民族對他們還是非常寬容和友好的，彼此也很和睦。但是以色列建國之後，阿拉伯民族和猶太民族形同水火。