不能。

明朝整體的軍事實力已經非常衰弱了，與前期成祖“犁庭掃穴”已經完全不可同日而語。明朝唯一一次有機會做到滅其老巢的就是薩爾滸大戰，關於薩爾滸戰敗的內容之前已經多次提到了，總之，薩爾滸明軍在戰前就沒有什麼勝算。

在薩爾滸大敗後，明朝喪失了戰爭的主動權，也就是題主所說的一舉擊滅對方老巢的能力。遼瀋的失守意味著明朝對遼東已經無法行使主權，當時的戰爭形勢是一邊倒的。自從袁崇煥接手遼東（實際是遼西）以後，遼東的軍力開始恢復，但完全不具備主動出擊的能力，當時的大政方針是以炮守城，漸次恢復。

但是自從袁崇煥死後，整個東北的局勢就完全不同了，此後遼東在也沒有出現一個像袁崇煥一樣的大帥。遼東守且不足，遑論出擊？之前已經說過很多次，再提一次，明朝已經很難調兵到遼東了，遼人守遼土實在是沒有辦法的辦法。與後金/清作戰的主力就是遼東軍隊，別的地方不能說沒有，但可以忽略不計。山西、薊鎮、陝西同時還面臨著蒙古人的虎視眈眈，當時的形勢非常不樂觀。

清軍入塞以後，意味著明朝腹心受到清軍的威脅，明朝的第一反映是調附近的軍隊勤王，崇禎二年首次入塞的時候，袁崇煥就是在這種情況下帶兵入衛的，其實袁崇煥也想過要進攻後金老巢，但京師安危重於一切。此後入塞，遼東的軍隊也面臨關外清軍的攻擊，根本抽不了身，遼東能在清軍入塞時保持防守得當已經很不容易了，根本不要想進攻的事情。以大順軍隊進軍北京，明朝放棄遼東，命吳三桂保衛北京來看，遼東屬於可以犧牲的一個部分。

對於明朝而言，根本不具備進攻清軍後方的能力。此外，清軍入塞並不是舉國進攻，他們會留不少的軍隊駐守遼東，以多爾袞山海關大戰來看，清軍留守的軍隊依然有1/3，因此，清軍的老巢並不空虛，明朝即便派兵過去了也毫無勝算。

就算有實力，你把建奴老窩搗了有什麼用，人家精壯年都入關搶劫去了，剩下的都是老弱婦孺，你以為後金那會兒真像什麼狗屁《太祖秘史》演的那麼騷氣？糧食都靠搶的團伙，家裡能有多少財產，還不夠明軍大部隊的軍糧。人家十萬人入關搶劫，你大部隊去抄他的茅草屋，關內老百姓管不管，皇帝你還要不要？孫臏圍魏救趙那是因為他領導是齊王而不是趙王，你看龐涓敢不敢圍齊救魏？