一是高山缺氧

二是凍土問題

三是環境保護

四是不影響動物遷徙

五是地形複雜問題

一 ：工程人員為了解決氧氣缺少影響工作人員工作,使得工程緩慢的問題,把大型製氧機帶到了高原,為打造隧道的工程人員提供充足氧氣,當時洞中氧氣含量只相當於海拔1000米左右大大加快了工程的進度。

二：凍土問題是中國乃至世界最大凍土研究基地為了攻克凍土難題，自青藏鐵路開工建設以來，鐵道部高度重視青藏鐵路凍土攻關難題，先後安排了上億元科研經費用於凍土研究，並組織多家科研院校的專家，對青藏鐵路五大凍土工程實驗段展開科研攻關，獲得了大量的科研資料和科研成果。青藏鐵路凍土攻關借鑑了青藏公路、青藏輸油管道、蘭西拉光纜等大型工程的凍土施工經驗，並探討和借鑑了俄羅斯、加拿大和北歐等國的凍土研究成果。目前，中國科學家採取了以橋代路、片石通風路基、通風管路基、碎石和片石護坡、熱棒、保溫板、綜合防排水體系等措施，凍土攻關取得重大進展，青藏鐵路已成為中國乃至世界上最大的凍土研究基地工程人員在高原動土上打了上千個水泥樁埋在動土下面,為鐵路的運營提供充足的支撐力。

三：為了保護高原湛藍的天空、清澈的湖水、珍稀的野生動物，青藏鐵路僅環保投入就達20多億元，佔工程總投資的8％，是目前中國政府環保投入最多的鐵路建設專案，並在全國工程建設中首次引進環保監理，首次與地方環保部門簽訂環境保護責任書。

四 ：工作人員首次為野生動物開闢遷徙通道，位於可可西里國家級自然保護區的清水河特大橋，就是青藏鐵路專門為藏羚羊等野生動物遷徙而建設的。

五 ：為了解決地形問題工程人員建設了 世界上海拔最高的火車站——唐古拉車站 ，這個車站也是目前世界上海拔最高的火車站