清政府對於邊疆管理設有駐藏大臣、烏里雅蘇臺將軍、庫倫辦事大臣、伊犁將軍、總理回疆事務參贊大臣。道光以後，駐紮大臣多由宗室、貴戚出任，官員素質下降，任期普遍縮短，魚肉百姓、消極懈怠，造成清代中後期嚴重的邊疆危機。總的來說，清政府在道光朝前對邊疆管轄有積極意義，之後基本無意義。

清政府地方機構分省、道、府、縣四級。省最高官員為總督、巡撫，管理轄區軍政、民政以及吏治，另外總督可能不止管理一省，例如林則徐就曾任湖廣總督（湖南、湖北）、陝甘總督（陝西、甘肅）等；道最高官員稱為道員，俗稱道臺介於省、府之間，無固定行政區劃分，主要負責監察轄區吏治、大案要案等，題外話：歷史上並無什麼八府巡撫（或八府巡按），那只是戲劇或民間杜撰，清朝一道所監察的地區遠多於八府，所以完全沒必要設立一個重複且作用不大的一個八府巡撫之職。府最高長官為知府，設立同知、通判等官職；縣最高長官為知縣，設立縣丞、主薄等官職。另外，在一些少數民族地區還設立有自治權比較大的土司衙門等地方管理機關。

清朝自從順治立國，對地方治理設總督，巡撫，布政司，藩臺，道臺，府臺，知縣等文職官員，雖然沿襲了前朝的部分治國方略，可是因為旗人少，所以加大了對漢族人民的欺壓，特別實行了奴化教育，造成了清朝以致民初的社會風氣落後，愚昧無知，被八國聯軍戰敗後，簽訂了一系列不平等條約，崇洋媚外，進一步造成了中華文明的倒退。清朝統治的時期是中華歷史上最黑暗的時期。