這種情況，在醫學上稱為胃腸神經官能症，又稱腸道功能紊亂，在過去，稱為腸激綜合症，特徵是腸道功能的易激性，以腸道生理功能紊亂為基礎，以腹痛、腹瀉、便秘為臨床特徵，主要病機為脾胃虛弱，運化失常，夾瘀夾溼，造成溼濁停留，內熱蘊結。

熬夜後早晨拉肚子，就是脾胃失和，尤其是腸道菌群紊亂所導致的。

通常來講，半夜到第二天凌晨4點之間，是人體給消化系統補血、補養的時間段。

腸神經肽裡，有一種叫血管活性腸肽，又叫舒血管腸肽，是神經遞質的一種，它能造成腸道和中樞神經互相影響。

人熬夜，不睡覺，中樞神經系統就會透過血管活性腸肽刺激腸神經，使腸道不停運作，不能在應該休整的時期休整，而腸道又會分泌血管活性腸肽，反向刺激中樞神經，造成惡性迴圈。久而久之，腸道的分泌機能就會失調，腸道里的菌群得不到控制，在腸道內形成炎症，不嚴重，但是很討厭。

一般來講，只要胃腸道功能還沒有明顯弱化，出現這種情況也不要緊，只要合理作息，健康飲食，短期之內就可以調整過來。

但是如果再繼續發展下去，就會出現反覆有便意，只有吃一些食物才能得到控制，或者吃完東西后短時間內產生急促的便意。若熬夜的人長期嗜煙酗酒，就很容易變成這樣。

但也不要緊，只是需要靠服用一些藥物來幫助調整。乳酸菌素片就可以，不過療程是比較長的，起碼要一兩個月才起效。平時還要注意飲食規律和飲食衛生，不要吃刺激性的東西。

把熬夜和拉肚子聯絡起來，有人會覺得奇有些怪。這可能是結腸炎的表現，需要注意調養，不吃辛辣。不粘菸酒，不吃生冷食物，避免著涼，早睡早起，多運動鍛鍊，提高免疫力，養成健康規律的生活習慣。

如果熬夜或者緊張就會拉肚子，檢查後又找不出拉肚子原因，也可能得了“腸應激綜合症”。是很常見的胃腸道功能疾病，因為生活節奏的加快，壓力大，造成精神緊張，導致腸道活動和分泌功能的紊亂。對於該病的治療方法，要先消除精神緊張，病情便逐漸變好。日常吃一點調節自主神經的藥物，如中藥參苓白朮散、香砂養胃丸等有一定療效。 熬夜很傷身體，體質陽虛的人，還可以吃些熱性食物，比如牛，羊肉。

瞭解了這些原因，生活一定要要有規律、不熬夜，注意休息，不要讓腦子總處在緊張狀態，做到勞逸結合，多參加散步，爬山，旅遊等健康活動，多吃富含纖維素的食物，比如芹菜、茭白、竹筍等蔬菜。要合理搭配膳食。

身體處於亞健康狀態，脾胃虛弱的人抵抗力低，若經常熬夜，特別是在寒冷的冬天屋裡溫度低，身體受涼就會引起腹瀉，胃腸功能紊亂致，身體強壯抵抗力就強，偶爾熬夜不會腹瀉。建議多吃山楂、大棗、雞內金、小米粥、橘子、蘋果等健脾胃的食品，食療比藥療好，厲害了就去醫院治療，儘量早睡早起，多運動，再忙也要愛惜身體。

早晨拉肚子是大腸的問題，那麼為什麼跟熬夜又相關呢？因為熬夜傷的是肝，肝與大腸相別通！就是說傷到肝會連累到大腸，所以熬夜的人往往早晨拉肚子。