蛋殼的顏色主要由原卟啉、膽綠素（包括和鋅結合的膽綠素）決定。這兩種物質比例不同，蛋殼就呈現不同顏色。 原卟啉產生黃色、紅色和褐色，膽綠素產生藍紫色和綠色。膽綠素的形成主要是新陳代謝過程中，衰老的紅細胞在肝臟被破壞的時候產生，原卟啉則主要由雞的輸卵管細胞合成。 蛋殼顏色也與品種密切相關，具有遺傳性。目前國內的蛋雞主要是羅曼褐、海蘭褐、海賽克斯褐等引進的品種，加上中國自主培育的品種，大約85%的雞蛋是紅褐色系。

擴充套件資料： 雞蛋的殼色以白色和褐色兩係為主，兼以粉、綠兩系，這四種顏色基本可以涵蓋所有殼色。在商品蛋雞中，白殼蛋雞主要以白來航雞為祖代培育而來，褐殼蛋雞主要以羅島紅培育而來。 粉殼蛋雞則是由白殼蛋雞與褐殼蛋雞雜交而成的品系。而綠殼是一種變異型，成型的綠殼蛋雞品種都是經過純化的，以保證能較多地產出綠殼蛋。蛋殼顏色是檢驗品種純度、產品均一性等的重要指標，在生產中，一般用色差儀來測定。

蛋殼的顏色主要是由一種稱為軟殼，普寧的物質決定的普通母雞血液中的血紅素代謝可產生卵殼卟啉 而因蛋殼可呈淺紅色，而來航雞與白洛雞不能產生卵殼卟啉 因而蛋殼呈現白色 顏色完全是由遺傳基因決定的，其主要是由於機種和雞飼料不同造成的大型雞飼養場所用的飼料含色素較少，且伴有白色魚粉，固氮和多層白色，而紅蛋殼一般是由散戶養的，雞所生飼養餵養飼料品種複雜，且飼料中含有葉黃素較多，所以蛋殼呈紅色，還有餵養方式和吃的東西不一樣清淡可又稱綠殼蛋，下蛋的雞為母雞，烏雞和土雞的改良品，雞是天然散養，吃綠色蔬菜和雨露蟲草為主，蛋殼顏色有白淺褐色，深厚和青色脂粉，有人偏愛紅蛋殼，有人喜歡清淡，可一般產蛋量初期 蛋殼顏色最深，然後逐漸變淺，產蛋量高的母雞，尤其蛋殼顏色較淺，透過選育可以改變蛋殼顏色的深淺