不直接佔領的原因有：

1.清軍沒有獲得完勝。雖反攻戰打得一直不錯，但最後一仗清軍前鋒被廓爾喀軍隊擊敗，正是此役打斷了清軍的進攻勢頭，也為廓爾喀軍隊求和贏得了時間和談判的條件。

2.清軍也不願付出更大代價。廓爾喀軍隊驍勇善戰，前鋒受挫後，繼續進攻並佔領他國將付出更大代價。

3.清朝沒有完全佔領的意圖。周邊小國能臣服，願意朝貢，甘當被保護國就可以了。大清朝也樂得周邊安寧。

4.清朝實力有限。戰爭初起時，藏軍可用、能戰兵力少，朝庭駐藏兵力更少。是大清被廓爾喀軍隊打痛後才調集他地軍隊反攻的。並非清朝兵力綽綽有餘。

5.長期佔領加德滿都的話，雖有戰略意義，但要駐兵於此，人力物力的消耗巨大，收穫並不一定大於付出。

6.會失去與英殖民者的緩衝地帶。佔領了加德滿都，那就要佔領全境了，否則會被不斷的起義所折騰，首都也佔不住的。佔領了他國，大清就和英殖民者面對面了，當時大清不想同英打仗，沒有緩衝帶雙方容易擦槍走火。

之後，英如何進軍西藏，那是後話。也是英國曆史上的戰爭罪行。

鑑於以上原因，清軍不會直接佔領加德滿都。

駐兵需要大量的人力物力，駐多了養不起，駐少了不管用。

乾隆主要是炫耀武力，炫耀完了就撤回來就是了。