玉米根部有分叉不用去掉，玉米每個節位的葉腋處都有一個腋芽，除去植株頂部5～8節的腋芽不發育以外，其餘腋芽均可發育；最上部的腋芽可發育為果穗，而靠近地表基部的腋芽則形成分櫱(分叉)。由於玉米植株的頂端優勢現象比較強，一般情況下基部腋芽形成分櫱的過程受到抑制。但是，玉米植株產生分櫱的時間大多發生在出苗至拔節階段，形成分櫱的原因主要是外界環境條件的影響削弱了玉米植株的頂端優勢作用所致。　　同樣條件下，品種之間有差異，比如某外資玉米品種在東北地區前些年一直都有類似的情況發生，這與品種的特性有關。除此之外，同一的品種，早播的、稀植的、遇高溫乾旱的、高肥水的、遭受苗後除草劑藥害、抗倒劑過量或過早、薊馬或瑞典稈蠅危害等因素，均會導致分叉相對較多。但要與粗縮病區分開來，因為粗縮病是毀滅性病害，一般病株明顯矮化且大多後期不能正常結實。　　現在學術界對此的觀點有分歧，掰不掰掉分櫱對產量的影響並非絕對的。有學者實驗“掰掉玉米分櫱比不掰掉分櫱增產，但是幅度很小”；也有學者實驗“說明不掰掉玉米分櫱比掰掉分櫱增產，而且增產幅度很明顯”。而且有的學者認為“由於去分叉時所致的傷害(傷口修復、病蟲害侵害等)會造成減產”。　　一般小面積農戶，看著田間的分叉“心裡不舒服”，如果有時間，可在出現分叉後儘早拔除，越早越好。拔除分櫱的時間以晴天的上午9點至下午5點為宜，以利於掰除分叉後形成的傷口能夠儘快癒合。一般種植面積較大農戶，因僱工費用較高且增產或減產並不明顯，不建議掰除分叉。