九陽神功最強，其次九陰神功，最後北冥神功。

九陽神功特效，練至最高境界內力大增，而且內力產生速度奇快源源不斷。這一點就已經可以抵禦北冥神功了。不論北冥吸的內力再多，因九陽神功而產生的內力可以源源不斷的補充，不會枯竭。九陽神功具有克劇毒，克陰寒的能力。曾看到一句話“氤氳紫氣，毒氣不生”，就是形容的九陽神功。中了至陰至毒的玄冥神掌，在練成九陽神功之後可以醫愈，而九陰真經就沒有這個效果。九陽神功痊癒能力極強，幾乎帶有不死之身的性質。中了倚天劍重傷的張無忌，憑藉九陽神功可以不死，稍加休息又可以恢復如初。九陽神功的護體反震能力極強，張無忌和滅絕師太對掌，輕鬆就把滅絕師太震飛老遠並且打成重傷。九陽神功雖然沒有外功招式，但是在它的加持之下，就連最基本的拳腳都能打出成噸的傷害。論九陽神功之強，不會在易筋經之下。

九陰真經，可以衍生外功招式，周芷若學的速成版的衍生招式九陰白骨爪。黃衫女子學的完本九陰真經，衍生了九陰神爪，威力遠大於九陰白骨爪，幾招之內就把周芷若制服。九陰真經相比於九陽神功，並沒有剋制陰寒傷害的效果，而且也沒有剋制劇毒的能力。雖然練完九陰真經之後，內力會大增，但是九陽神功也如此，所以二者難分伯仲。九陰真經的內力產生速度似乎也不如九陽，雖然九陰神爪很強攻擊力很霸道，但是九陽神功的護體下如同超肉的坦克而且護甲具有反傷效果，所以九陰神爪也未必能奈何的了九陽神功。郭靖練的是九陰真經+降龍十八掌。如果張無忌會降龍十八掌+九陽神功，那恐怕和郭靖對打，郭靖會被打成重傷。

按照金庸老爺子書中所講述，九陽神功＞九陰真經，九陽神功強在它的內力方面，學會九陽神功，內力強大到無與倫比，具有護體的功效，學什麼武功都非常快，參考張無忌。九陰真經裡面的武功招式比較獨特，也比較毒辣，比如裡面的九陰八骨爪的武功，陳玄風和梅超風因為學了九陰真經，令江湖聞風喪膽，但遠遠沒有達到五絕的水平。九陰九陽一陰一陽，按照陰陽原理，九陽神功＞九陰真經，所以更強於九陰八骨爪。