明朝水師從鄭和下西洋好就很脆弱了。當時大部分倭寇的主力都是沿海居民。正兒八經的日本人反而只是下層打手。上層大部分是沿海被當時政策逼得走投無路的人。後來政策改了，倭寇很快就消失了

明朝的水師厲害，其實只有兩個階段，一個是明初洪武和永樂兩朝，另外一個是在嘉靖後期到萬曆前期。此外的大部分時間，大明實際上是海備廢弛的。

在嘉靖朝倭寇擾亂東南的時候，大明已經開始重新著手東南水師的重建工作了。當時在浙江負責打海戰的將領恰好是俞大猷將軍，再多次對我作戰和與葡萄牙殖民者的接觸中，俞大猷總結出了一套頗有近代風格海戰心德。他認為要想在海戰中佔優勢，無外乎“大銃勝小銃，大船勝小船”，主張利用火力優勢在海面上解決倭寇的運輸船。

但由於資金問題，再加上俞大猷實在是沒人保他，再被調往大同後，這個水師計劃就進展的很慢了，一直到嘉靖最後的幾年，俞大猷原來帶出來的將軍才開始在朝廷的旨意下大力發展水師。

其實俞大猷在浙江的時候，他手底下的水兵曾多次擊敗倭寇，以至於倭寇想把船開進浙江，必須要等到三更半夜的時候偷偷的才可以。

不過雖然俞大猷海戰牛的一批，但是在陸地上對抗倭寇，反倒就沒那麼得心應手了。

當然，在戚繼光剛剛調到浙江的時候，面對的情況和俞大猷是一樣的。主要問題不在於指揮不利，而是兵不行。和北方計程車兵不一樣，浙江的兵很有想法，說白了就是不那麼好聽話。也是因為這個原因，戚繼光才不斷請求重新練兵。

另外，這個時候的倭寇在浙江和福建有了很多軍事據點，相比之下，海路攔截倭寇就不如端了倭寇在大陸上的老巢重要了。這也就是為什麼後期的抗倭戰爭重點都在陸地上的原因。