個人覺得有如下原因

客觀原因:木葉忌憚佐助，安裝手臂後實力太強

佐助作為木葉的叛忍闖入五影會談，大戰忍界聯盟，最後操縱眾尾獸消滅忍軍聯盟後被鳴人擊敗，終被鳴人嘴遁感化。後被收監在木葉看在鳴人的份上沒有被殺！佐助無論後期如何洗白都改變不了他曾經叛忍的事實！因此在接受接手臂的問題上要比鳴人困難的多！以佐助的性格也不願去求木葉的人因此無法順利移植手臂！佐助被迫流浪在忍界而不在木葉居住也可能因為木葉的不信任有關，畢竟木葉經不住第二個宇智波一族的內亂！

個人原因:對鳴人及曾經傷害過人的愧疚

佐助因為自己對一族與村子的理解確定向木葉復仇，在這期間殺害了很多木葉的忍者，也曾對小櫻痛下殺手！後被鳴人感化站在守護木葉的一邊，面對曾經傷害過的人定是愧疚萬分！即便與小櫻結婚但也不願在木葉居住！

作者原因:作者價值觀的提現

佐助作為男二號的存在，在做出反叛曾經同伴的過錯後隨後來改正，但作者依舊認為做錯事必然要受到應有的懲罰！斷一臂是最好的懲罰！

佐助個人行為:這很帥，不影響我單手開法拉利

逼王就要一裝到底，即便是斷臂也要讓你們看到我們之間的實力差距

——宇智波佐助

負罪之身

　　佐助到了忍界大戰結束之時，還想著抓緊把五影給處決了，再加上之前叛逃後的所作所為，要不是有鳴人護著，村子裡的人可未必會容忍佐助的存在，畢竟木葉白牙這種英雄都被中傷到自殺的程度，木葉村的群眾可是能說死人的。

　　所以斷個胳膊，也算是博取同情了，另外也稍微讓人不會過於忌憚自己的實力。

　　斷臂玩劍養大雕（通靈獸），佐助的這個形象和楊過不要太相似。

　　而且佐助的核心力量來自於瞳力，少個胳膊對於實力並沒有實質性的影響，何必欠木葉村一個人情呢。

　　以上就是來自小宅基的正義解答啦，有關動漫的題目都可以詢問小宅基喲，作為混跡二次元多年、宅腐萌呆汙各屬性精通的小宅基才不會一本正經的胡說八道呢，嘿嘿嘿嘿~~麼麼噠！