曾國藩在率領湘軍攻克南京以後，已經相當於控制了全國最大的軍事力量，為何不取清政府而代之或許因為以下幾點：

一、曾國藩的忠君思想，儒家思想薰陶使得曾國藩忠君思想根深蒂固，他創立湘軍最初的目的就是保衛清政府，保衛孔孟之道，對於太平天國的上帝教不能苟同，勢必滅之。

二、清政府對其已經有所防範，在湘軍連連大捷的時候，對於曾國藩的封賞卻是原地踏步，沒有過多的加官進爵。而攻克南京之後，“取江寧者為王”的許諾也成了一紙空談，還追究洪天貴福逃脫之責。而打下南京以後，湘軍人心思歸，戰鬥力削弱，而且外國勢力依舊支援清政府。

三、太平天國雖然被滅，但是北有捻軍起義，外有各個列強虎視眈眈，趁機奪利，若是曾國藩再反叛，必定又會使百姓處於更加水深火熱之中。

所以曾國藩在平定太平天國之後，便上書將功勞歸於朝廷，另外申請裁減湘軍，消除清政府的戒心。

天京陷落的時候，不但太平軍是殘兵剩勇，其實湘軍也已是癌症晚期，如果太平軍再撐一段，搞不好湘軍自己就會垮掉。

十幾年的湘軍，內部早就潰爛。曾國藩的兵制本身就有問題，他的部隊是一級一級承包下去的，曾國藩並不能跨級指揮下面的軍官。他並不希望屠城，但是控制不了。一旦天京城破，下層官兵想的就是搶錢回家。

退一步說，即便湘軍還想再往北打，也不是想當然的就能贏。湘軍能打贏太平軍，利用了很多清政府提供的隱含資源。如果湘軍造反，這些資源就不在了。

最簡單的講，以前湘軍給朝廷辦事，各省督撫雖然不幫你，但也不至於打你一頓。你要造反的話，還是這樣麼？你所經之處，人家不全力圍剿你？湘軍孤軍北上挑戰朝廷，後方全無支援，兵源不能補充，沒有棉衣，沒有糧食，每一個州縣都打你，你能走多久？林鳳祥是怎麼完蛋的？

別的人不說，李鴻章不制約你？太平天國後期，淮軍的武器已經是中國最先進的了。

以上純粹從軍事角度考慮。

如分析曾國藩這個人，他本身性格和能力，也不適合造反。