這個問題有點太深奧了。如果真的要搞明白你可以去看電動力學，還有量子力學，光學可以解釋這個問題。

但是我還是從最普通的角度來解釋一下這個吧。

光是無色透明的。但是牛頓的色散實驗告訴我們光是由多種顏色合成的。

而顏色是光是具有波的性質。物體會吸收光的某些波段導致光的波丟失了一部分。不完整的光呈現出各種顏色射入眼睛，人就看到色彩了。

那麼水，玻璃這種東西，尤其是沒有雜質的純水和極其乾淨透明的玻璃他沒有造成光波的損失，光直接透過玻璃射入眼睛所以人可以看到。

而不乾淨的水和玻璃因為雜誌存在我們可以知道那裡有東西。是因為那些髒東西導致光的損失。此外還有光的折射造成光的路線改變使得我們看到物體錯位。例如木棍插入水中，木棍歪曲。玻璃杯中的水扭曲了光線水和玻璃的不同折射率使得我們清楚那裡有杯子和水。

而為啥有些是折射有的是反射呢。這個就是很嚴謹的問題了。簡單說不管是波粒二象性的哪種特性，因為物質本身不同，光波或者光量子打擊在原子上被反彈出來（這裡只是做個比喻）而入射角度等多方面原因造成有的折射有的反射。

這裡只是個比喻，具體原理太深奧，我沒學過不知道怎麼表述。

例如光入射水面會同時發生反射和折射。

布里面的每一根絲線使得光線被反射走了。而會有部分光量子會透過縫隙穿過來。所以黑色的緻密的多層窗簾才能擋住光線。營造黑色房間。