鯊魚被劃分為八個目，每個目都是按照共同的身體特徵將不同的種合併在一起。雖然看起來很簡單，但將鯊魚分類並不容易，因為用來對其定義的實際特徵並不總是顯而易見的。用來區分鯊魚的這些特徵包括鰓裂的數量，鰭的數量和型別，眼睛上是否存在隔膜，繁殖方式，甚至是包括腸內瓣膜的結構。結果，兩種看上去非常相似的鯊魚可能是完全不同目中的成員，例如灰鯖鯊和青鯊；同樣看上去非常不同的兩種鯊魚也可能屬於同一個目——星鯊和雙髻鯊就是這樣的恰當例子，它們都屬於真鯊目。

對鯊魚分類非常複雜，以至於專家不能就某些種屬於什麼目完全達成一致。一些權威人士將只有一個已知種的皺鰓鯊劃分為一個單獨的目，稱為皺鰓鯊目。同時其它人則將名為棘鯊的群劃分為一個叫做“棘鯊”的目，而大多數的分類學者則將棘鯊的兩個種劃歸角鯊目。

八個被大多數人認可的目是：

虎鯊目：牛頭鯊，包含一個單獨的屬，有包括角鯊在內的10個種。

鬚鯊目：斑紋鬚鯊。有包括鯨鯊，鬚鯊和豹紋鯊在內的34個種。

鼠鯊目：鯖鯊。16個種，包括大白鯊和灰鯖鯊等有名的鯊魚。

真鯊目：睡鯊。是有270多個種的最複雜的群，包括虎鯊、雙髻鯊和黑鰭礁鯊。

六鰓鯊目：扁頭哈那鯊。4個種，有6個或7個鰓裂。

角鯊目：星鯊。約有115個種，包括星鯊，花斑鯊和模拉里烏鯊。

扁鯊目：日本扁鯊。約18個種，該目的所有鯊魚都具有獨特的扁平身體形狀。

鋸鯊目：鋸鯊。8個種，該目所有鯊魚都有獨特的鋸形嘴。