珠峰計劃是響應錢學森“為什麼我們培養不出頂尖人才?”而設立的基礎學科人才培養計劃，包括數理化生、計算機五個方向，以培養頂尖科學家為目標，只在北大、清華等十幾所高校實施，如北大的“元培計劃”。強基計劃也是面向基礎學科的人才培養計劃，增加了文史哲方向，以培養基礎學科和服務於國家重大戰略的拔尖人才為目標，參與的高校有36所，覆蓋範圍更廣，規模更大。

一個是旨在培養中國自己的學術大師，一個是為了選拔培養有志於服務國家重大戰略需求且綜合素質優秀或基礎學科拔尖的學生。一個追求頂尖，一個強化整體

區別一，定位不同。珠峰計劃是以諾貝爾人才為中心而實施的計劃；強基計劃是為了服務國家重大戰略需求而實施的計劃；

區別二，院校數量不同，珠峰計劃有19所院校，強基計劃有36所；

區別三，培養模式不同，珠峰計劃雖然都是國家一級重點學科，一流教師，但是沒有本碩博一體化培養模式。而強基計劃有這種模式，而且實行小班化教學方式；

區別四，專業範圍不同，相比於珠峰計劃的數學、物理、化學、生物、資訊科技五大專業範圍，強基計劃又增加了歷史、哲學、古文字學等專業範圍。如果說珠峰計劃專業範圍偏理的話，強基計劃兼顧了文理，範圍更加廣，更加全面。