攝像頭連線顯微鏡要求攝像頭本身具備C介面或是CS介面，要求顯微鏡是三目的並且配備攝像介面，然後攝像頭透過攝像介面跟顯微鏡連線上，而電子目鏡裝的位置是直接將目鏡取出，插在裝目鏡的位置，這樣的話如果是雙目的，那麼只有一隻目鏡可以人眼觀察了，如果是單目的，那人眼就沒法觀察了。三目顯微鏡的好處是除了接攝像頭外，還可以兩隻眼睛觀察 。另外電子目鏡的畫素很低，一般在30萬畫素左右，攝像頭可選的種類很多元話了。按輸出訊號可以分模擬式跟數字式，模擬式又分450線480線540線等，模擬式可直接接電視或是監視器，加採集卡後可以接電腦。數字式的有130萬畫素、300萬畫素 500萬1000萬等。USB直接接電腦，可拍照、錄影，二次開發的話可測量、分析等。電子目鏡是數年前的產品了，那時攝像頭還沒有300萬的呢，更不要說500萬1000萬了。現在很少有配電子目鏡的了。淘寶買個300萬攝像頭，價格400元左右，效果就比電子目鏡好很多，就更不要說價格上千元到數千元甚至上萬的了。攝像頭現在可以說早就取代了電子目鏡了，分別上圖你一比較就知道了。

另外像以前使用者買的顯微鏡是單目或是雙目的，當時沒有配電子目鏡或是攝像頭，現在想配上去，那樣的話也是將一隻目鏡取出，透過一隻專用的攝像介面，攝像介面插在目鏡的位置，攝像頭接攝像介面上，也是可以的。