依據自2019年12月1日起施行的《陝西省秦嶺生態環境保護條例》，秦嶺保護劃分為核心保護區、重點保護區和一般保護區。

核心保護區包括：

（一）海拔2000米以上區域，秦嶺山系主樑兩側各1000米以內、主要支脈兩側各500米以內的區域；

（二）國家公園、自然保護區的核心保護區，世界遺產；

（三）飲用水水源一級保護區；

（四）自然保護區一般控制區中珍稀瀕危野生動物棲息地與其他重要生態功能區集中連片，需要整體性、系統性保護的區域。

經初步測算，核心保護區面積為0.81萬km²，佔秦嶺區域面積約14％，與2017年條例規定的“禁止開發區”面積佔比0.77％相比，提高了近20倍。

重點保護區包括：

（一）海拔1500米至2000米之間的區域；

（二）國家公園、自然保護區的一般控制區，飲用水水源二級保護區；

（三）國家級和省級風景名勝區、地質公園、森林公園、溼地公園等自然公園的重要功能區、植物園、水利風景區；

（四）水產種質資源保護區、野生植物原生境保護區（點）、野生動物重要棲息地，國有天然林分佈區，重要溼地，重要的大中型水庫、天然湖泊；

（五）全國重點文物保護單位、省級文物保護單位。

經初步測算，重點保護區面積為1.76萬km²，佔秦嶺區域面積約30％。

一般保護區包括:

秦嶺範圍內除核心保護區、重點保護區以外的區域，為一般保護區。

經初步測算，一般保護區面積為3.25萬km²，佔秦嶺區域面積約56％。