專案牽頭單位和專案負責人應在專案執行期結束後3個月內完成專案綜合績效評價材料準備工作，並透過國家科技管理資訊系統向專業機構提交如下材料。 （1）專案綜合績效自評價報告。 （2）專案所有下設課題相關績效評價材料及績效評價意見。 （3）專案實施過程中形成的智慧財產權和技術標準情況，包括專利、商標、著作權等智慧財產權的取得、使用、管理、保護等情況，國際標準、國家標準、行業標準等研製完成情況。 （4）與專案任務相關的第三方檢測報告或使用者使用報告。 （5）成果管理和保密情況，說明研究過程中公開發表論文和宣傳報道、對外合作交流、接受外方資助等情況；保密專案和擬對成果定密的非保密專案還需說明成果定密的密級和保密期限建議、研究過程中保密規定執行情況等。 （6）任務書中約定應呈交的科技報告。 （7）科技資源匯交方案，根據《國務院辦公廳關於印發科學資料管理辦法的通知》的要求和指南規定需要匯交的資料，應提交由有關方面認可的科學資料中心出具的匯交憑證；對於專案實施過程中形成的科技文獻、科學資料、具有宣傳與儲存價值的影視資料、照片圖表、購置使用的大型科學儀器、裝置、實驗生物等各類科技資源，應提出明確的處置、歸屬、儲存、開放共享等方案。 （8）審計報告和相關補充說明材料等（審計報告由會計師事務所上傳）。 專業機構應在收到專案綜合績效評價材料後6個月內完成專案綜合績效評價。 ????~

綜合績效評價的指標：

1、管理績效定性評價指標　　企業管理績效定性評價指標包括戰略管理、發展創新、經營決策、風險控制、基礎管理、人力資源、行業影響、社會貢獻等八個方面的指標，主要反映企業在一定經營期間所採取的各項管理措施及其管理成效。

2、財務績效定量評價指標 　　財務績效定量評價指標由反映企業盈利能力狀況、資產質量狀況、債務風險狀況和經營增長狀況等四方面的基本指標和修正指標構成。 “開展企業綜合績效評價應當制定既符合行業實際又具有標杆引導性質的評價標準，並運用科學的評價計分方法，計量企業經營績效水平，以充分體現行業之間的差異性，客觀反映企業所在行業的盈利水平和經營環境，準確評判企業的經營成果。”