首先幽門螺旋桿菌的治療方案是由醫院界研究公認的根治方案，主要常用的就是三聯或四聯用藥，但是幽門螺旋桿菌生存頑強，所以一般根除後會反覆發作，但是根除幽門螺旋桿菌的指標主要還是藥物治療結束後，檢測幽門螺旋桿菌之少在4內無復發。幽門螺旋桿菌是一種微需癢菌，體型呈螺旋狀，一般進去胃內會在胃粘膜下寄生，而且不斷適放毒素，所以很容易出現慢性炎症、重者出現潰瘍及惡性病變，而且在人體牙菌斑中也有存在，所以會經過餐具、口水等途徑傳播，幽門螺旋桿菌的根除是比較難的，在胃粘膜下寄生所以一些藥物是很難穿透的，所以選用一些最敏感的抗生素治療。

幽門螺旋桿菌感染的患者會導致胃腺體受刺激出現胃液的分泌過多，使得出現反酸燒心症狀，而且還會破壞胃粘膜，導致出現上腹部隱痛不適，適當毒素還會出現腹脹不適、食慾不振等表現，因此患有胃病的患者95％都有幽門螺旋桿菌感染，所以對於胃部不舒服的首先要檢測幽門螺旋桿菌，重者可行胃鏡檢查。對於幽門螺旋桿菌的治療，首先就是三聯療法（奧美拉唑＋甲硝唑＋羥氨苄西林)，除此之外還有注意飲食，避免進食一些刺激胃酸過多的食物，三聯治療效果差或是胃粘膜受損嚴重者可選用四聯用藥（奧美拉唑＋枸櫞酸鉍鉀＋克拉黴素＋阿莫西林)，規律服用4～8周，複查幽門螺旋桿菌，但是幽門螺旋桿菌對於青黴素類藥物最為敏感，而對於氨基糖胺類、四環素類、頭孢類抗生素高度敏感。