錦衣衛大家看電視劇普及的知識比較多，他是朱元璋建立明朝後，為了防止大臣篡逆奪權，設定的一個偵查機構。

六扇門原來是朝廷三法司衙門的統稱，在每個朝代都有所不同，因為古代衙門一般都是三開間，每間房安著兩扇門。所以民間百姓便以“六扇門”來簡稱官府。

明朝萬曆年間，宮裡爆出了著名的三大案，為了徹底查清楚此事，萬曆皇帝命人成立了一個集密探，捕快，殺手和武林高手於一體的秘密組織。因這個組織的總部坐北朝南，東南西三面開門，每面兩扇，一共六扇，所以也稱六扇門。因此萬曆年間所謂的“六扇門”和民間所代指的官府衙門還不是一回事。明朝六扇門專管江湖中人的大案，要案，或者緝拿長期被官府通緝的犯人。

從級別來看，六扇門歸刑部管轄，錦衣衛歸皇帝直接領導。

從權利來看，六扇門主管江湖上的是是非非，而對朝廷官員就沒有那麼大的權利了。而錦衣衛既管江湖事，又管文武百官，王侯將相。

明朝錦衣執行的一般都是皇帝的任務，所以錦衣衛比六扇門權利更大。

錦衣衛是天子親軍，特務組織，替皇帝暗中監督文武百官，專幹髒活的，六扇門是衙門公人的統稱，管治安，管老百姓的。

錦衣衛又叫錦衣親軍，明太祖時設立，前身是皇帝的禁衛軍，洪武晚年裁撤。明成祖是復設。直屬皇帝指揮，長官為都指揮使，正三品。位列為武官之首，錦衣衛有南北鎮撫司。其中“南鎮撫司”負責本衛的法紀、軍糾。“北鎮撫司”傳理皇帝欽定的案件，擁有自己的監獄（詔獄），可以自行逮捕、刑訊、處決，不必經過司法機構。簡單來說南鎮撫司就是內勤，北鎮撫司就是外勤。作為皇帝侍衛的軍事機構，錦衣衛主要職能為“掌直駕侍衛、巡查緝捕”，從事偵察、逮捕、審問等活動。也有參與收集軍情、策反敵將的工作，如在萬曆北韓戰爭中收集了大量的日軍軍情。其首領稱為錦衣衛指揮使，一般由皇帝的親信武將擔任，直接向皇帝負責。可以逮捕任何人，包括皇親國戚，並進行不公開的審訊。

六扇門就不一樣了，因為歷朝歷代六扇門就不是一個正式的機構，是刑部，大理寺，都察院三法司執行機構的合稱，民間百姓往往以“六扇門”來簡稱官府。在明代，三法司是歸屬內閣管理，往往皇帝是不能直接給三法司下令的，需透過內閣下令執行。

從屬上錦衣衛直屬皇帝指揮，監察百官和百姓。且不歸文官集團管轄，所以權力往往很大基本上不受制約，但是有時候錦衣衛也會被內閣控制，比如張居正時期。所謂的“六扇門”只是三法司的執行機構，類似於今天的法警角色。