（1）用於果蔬保鮮。用酵素進行果蔬保鮮實質上是藉助酵素的催化作用消除環境中能使果蔬腐敗的因子。如利用葡萄糖氧化酶可以進行果蔬除氧保鮮；溶菌酶可以進行滅菌保鮮。酵素保鮮的優點是高效、安全、穩定。缺點是價格高、重複利用率低。
（2）用於農產品加工。最常見的就是釀酒、釀醋、酸奶等。最常用的是酶有纖維素酶、澱粉酶、葡聚糖酶、糖化酶、蛋白酶、以及複合酶製劑。如木瓜蛋白酶常被大量用作啤酒、果汁飲料等的澄清劑，以去除其在儲藏過程中出現渾濁現象；木瓜蛋白酶還可用作肉類軟化劑，如在煮牛肉和排骨時，加入少量木瓜蛋白酶，不僅更加軟嫩，而且風味更佳。利用葡萄糖異構酶轉化果糖製成葡國糖漿，在糖果和糕點中應用。
（3）用於農產品質量檢測。農產品的質量檢測包括微生物檢測、重金屬檢測、農藥殘留檢測、轉基因檢測等。如利用膽鹼酯酶抑制劑法可快速檢測農產品中有機磷農藥殘留量。
（4）用作飼料新增劑。家禽、家畜、魚蝦蟹等動物體內有些酶系不完全或活性較弱，尤其是處於幼齡期的動物，在其飼料中加入酶製劑，會輔助這些動物消化吸收營養物質，從而提高飼料報酬，增強機體免疫力，提高養殖效益。酶製劑的作用機制主要包括：提高機體內代謝激素水平，提高免疫力；破碎細胞壁，提高飼料利用率；降低食糜的粘度，提高消化機能；消除抗營養因子；消除SNSP對內源消化酶的抑制；補充內源消化酶的不足；催化植酸鹽的水解反應等。
（5）用於生產維生素。利用微生物酶反應制造維生素。如以山梨酸為原料，經微生物氧化法生產維生素C。美國羅氏製藥廠利用微生物酶轉化法和化學合成相結合的方法生產維生素E，並實現了產業化開發。
（1）用於果蔬保鮮。用酵素進行果蔬保鮮實質上是藉助酵素的催化作用消除環境中能使果蔬腐敗的因子。如利用葡萄糖氧化酶可以進行果蔬除氧保鮮；溶菌酶可以進行滅菌保鮮。酵素保鮮的優點是高效、安全、穩定。缺點是價格高、重複利用率低。
（2）用於農產品加工。最常見的就是釀酒、釀醋、酸奶等。最常用的是酶有纖維素酶、澱粉酶、葡聚糖酶、糖化酶、蛋白酶、以及複合酶製劑。如木瓜蛋白酶常被大量用作啤酒、果汁飲料等的澄清劑，以去除其在儲藏過程中出現渾濁現象；木瓜蛋白酶還可用作肉類軟化劑，如在煮牛肉和排骨時，加入少量木瓜蛋白酶，不僅更加軟嫩，而且風味更佳。利用葡萄糖異構酶轉化果糖製成葡國糖漿，在糖果和糕點中應用。
（3）用於農產品質量檢測。農產品的質量檢測包括微生物檢測、重金屬檢測、農藥殘留檢測、轉基因檢測等。如利用膽鹼酯酶抑制劑法可快速檢測農產品中有機磷農藥殘留量。
（4）用作飼料新增劑。家禽、家畜、魚蝦蟹等動物體內有些酶系不完全或活性較弱，尤其是處於幼齡期的動物，在其飼料中加入酶製劑，會輔助這些動物消化吸收營養物質，從而提高飼料報酬，增強機體免疫力，提高養殖效益。酶製劑的作用機制主要包括：提高機體內代謝激素水平，提高免疫力；破碎細胞壁，提高飼料利用率；降低食糜的粘度，提高消化機能；消除抗營養因子；消除SNSP對內源消化酶的抑制；補充內源消化酶的不足；催化植酸鹽的水解反應等。
（5）用於生產維生素。利用微生物酶反應制造維生素。如以山梨酸為原料，經微生物氧化法生產維生素C。美國羅氏製藥廠利用微生物酶轉化法和化學合成相結合的方法生產維生素E，並實現了產業化開發。