強迫症。

霍華德·休斯在很早就表現出來，在30年代，霍華德·休斯的朋友說霍華德·休斯在吃他最喜歡吃的豆子的時候對豆子的大小非常介意，要用一個特殊的叉子把豆子按大小排序後再吃。在拍攝The Outlaw的時候，霍華德·休斯對Jane Russell的衣服的小問題表現出非常的執著，聲稱衣服上的褶暴露出了Jane Russell的乳頭。後來他給工作人員寫了一個詳細的備忘錄說明如何處理這個問題。

霍華德·休斯最終陷入了徹底的隱居狀態，每天把自己鎖在黑屋子裡面。儘管他有一個隨叫隨到的理髮師，霍華德·休斯每年才剪一次頭髮和指甲。在霍華德·休斯居住的地方通常會有好幾個霍華德·休斯高價僱傭的醫生，但是霍華德·休斯很少讓他們看病而且不聽他們的。在他生命的末期，霍華德·休斯的圈子裡主要為摩門教徒，因為他認為只有摩門教徒才可以相信。

在這一階段，霍華德·休斯對可待因，安定等多種藥物上癮，並且越來越虛弱。很多傳記和小說裡說他用牛奶瓶裝尿，並且用紙巾盒做鞋。但據報道他僅有一次馬桶漏水的時候用紙巾盒做鞋以“保護”自己。他堅持拿東西的時候要墊上紙巾，這樣可以把他和細菌隔開。霍華德·休斯很年輕的時候就感染了梅毒，在三期梅毒階段他的手上長了小水皰，一般認為醫生曾經在這一階段告誡他不要同別人握手，霍華德·休斯把這一不同別人握手的習慣保持了終生。霍華德·休斯還曾經燒燬了自己的全部衣物，有人認為這是因為他擔心他害怕梅毒細菌會寄生在他的衣物中