錦衣衛本質上是一種特務政治，是揭露官員隱私而不是檢舉不法的，對於清朝來說，摒棄錦衣衛的特務統治，一個很重要的原因就是它是少數民族政權，維護大清基業是整個滿族的根本利益。

全國各地的總督巡撫都由滿族親貴把持，因此不存在根本上的顛覆政權性質的謀反，搞特務政治也就沒有什麼必要了。

明清時期，都透過督察院之下的六科給事中和十五道監察御史的科道設定，監察制度更加系統化，在清代，監察御史由十三道改為十五道。其職司除了負責本道監察外還兼理中央各部的糾察。

這套監察制度，有利於皇帝對於官僚機器的有效控制，對皇帝來說他們是鷹爪，對於文武百官而言，監察官就是權力機關，透過這套制度，達到以官制官的目的，同時，監察官對行政權力的制約，也是皇帝對官僚系統垂直駕馭的必須，它會起到一個調節官員資源配置的作用。

例如漢代，除了御史大夫為2000石外，地方上的刺史才有600石。唐代御史臺除大夫三品外，監察御史只有八品，元代以後才升至七品。他們雖然待遇差品級低，但權力很大，可以參奏除皇帝之外的一切朝廷命官，故為人所忌憚。

這樣做的考慮就是，秩卑祿薄，更能激發起這些官員的責任心，少一些顧及，而權勢大，可以為他們彈劾糾察暢行無阻，提供便利。 但這些只是相對的，一般來說，監察職能更直接的受皇帝的影響，其權力的行使，需要皇帝的撐腰，而且他們畢竟是官僚，難以保持中立性，很快就會捲入朋黨之爭，為人所利用。

清代雖然沒有錦衣衛這樣的機構，但是有行使類似職能的制度，即“密摺制度”。這套制度並不亞於明代的錦衣衛。

所謂密摺，就是皇帝利用大臣之間相互監視從來達到了解大臣動態的目的。密摺制度起於順治朝，康熙朝得到推廣，雍正朝盛行。密摺內容要嚴格保密，不能抄寫、存放、隱匿、洩漏，用於密摺的紙張、書寫等也都有嚴格規定。

如雍正時期，皇帝對鄂爾泰提攜的廣州提督王紹緒不放心，所以讓廣州將軍石禮哈對其監視，石密奏：王紹緒念念不忘聖恩，志潔行清，勤於辦事；雍正還不放心，又命廣東巡撫傅泰進行偵察，傅密奏：王紹緒操守極好，只是稍覺有些懦弱。再如廣東總督郝玉麟作為廣東的一把手，經常密奏屬下官員的情況，同時，雍正也命廣東布政使王士俊對郝進行偵察。

當然，除了密摺制度以外，清代還有其他的措施，如清代的文字獄等。