目前，防治農業病蟲害所用的農藥，化學合成的農藥佔了絕大多數的份額，而生物農藥所佔的比例還很少。隨著人們健康意識、環境意識、生態意識的不斷增強，對農藥的要求會越來越高，既要求其能有效地防治病蟲害，又要求其對生態環境無顯著的影響，無疑這給生物農藥的發展提供了很好的機會。2007年開始，中國禁用了甲胺磷等5種高毒農藥，就給阿維菌素等生物農藥增加了一定的市場份額，所以可以肯定，生物農藥能夠在病蟲害防治中起到越來越大的作用。但是，生物農藥是不可能完全取代化學農藥的-這是因為首先在生物農藥發展的同時，化學農藥也在不斷地發展，也在不斷尋求高效、低毒、低殘留、環境相容性好的新產品，而且在不斷取得進步；其次，生物農藥在藥效穩定性、儲存、價格等方面還存在著一系列的問題，需要進一步改善。總之，生物農藥不可能完全取代化學農藥，但會在某些作物的病蟲害防治方面起到更大的作用。

俗語說：“滷水點豆腐，一物降一物”。自然界的生物也是一樣，這也是生物防治的基本原理。生物防治總體而言包括三個方面：以菌治蟲、以蟲治蟲和生物農藥。生物防治因為具有成本低、有效期長、不汙染環境、對人畜無害、害蟲不易產生抗藥性、減少農藥使用量和節約能源等優點，而受到廣泛關注。眾所熟知的BT毒素就是從蘇雲金桿菌中提取、並已獲得商業化成功的專門針對鱗翅目害蟲的毒素。中國的第一個昆蟲病毒殺蟲劑棉鈴蟲核多角體病毒(NPV)也於1993年完成了產品註冊登記。在赤眼蜂的快繁技術方面也取得突破性進展，並已研製出赤眼蜂卵機械化生產線。

國際上天敵昆蟲的天敵公司已發展到90餘家，2000年全球天敵銷售額達到5000萬元，預計全球天敵商品市場以每年15%~20%的速率增長。在利用性資訊素誘芯防治棉紅鈴蟲和稻縱卷葉螟方面也取得較理想的防效。害蟲生物防治在中國必將有廣闊的發展和應用前景。

但是，生物防治的不足之處也顯而易見。如殺蟲效果慢、質量不穩定、價格偏高、生產工藝落後。尤其在遇到害蟲大爆發時，不能起到立竿見影的效果。20世紀以來人口的快速增長，以及為解決糧食問題而採取集約化和單一作物種植方式，為害蟲的種群爆發提供了溫床。為減輕蟲害，防止減產，化學農藥便應運而生。化學農藥是利用農藥將有害生物的種群密度控制在經濟損失允許的水平以下，是目前全球應用最廣泛的害蟲防治方法，因對有害生物的快速殺滅而備受青睞。然而，由此而產生的害蟲抗藥性增加、對非靶標害蟲的毒害、以及高汙染高殘留，而引起環境保護署的關注。

鑑於兩種害蟲防治方法的各自利弊，生物防治和化學農藥只有聯合使用才能發揮更好的殺蟲效果。有人預測，在未來的很長一段時間內，化學農藥和生物防治將相輔相成，共同發展。