萬花筒寫輪眼(萬華鏡寫輪眼)是寫輪眼的較高階模式。

這種寫輪眼和普通寫輪眼的樣子有所區別。一般的寫輪眼是三個分開的勾玉，而萬花筒寫輪眼的三個勾玉連在一起，類似一個迴旋鏢的樣子。萬花筒寫輪眼可以有不同的樣子，卡卡西的萬花筒寫輪眼就和宇智波鼬的有所不同。每個人的萬花筒寫輪眼樣子都不一樣,而且斑從他弟弟移植的寫輪眼之後樣子和以前也有所不同。在寫輪眼的使用者中，不是每個人都潛力獲得萬花筒寫輪眼。即使是有潛力的人，也必須付出極大的犧牲才能如願。從目前看，萬花筒寫輪眼的獲得也至少有兩種方式。鼬的方式是殺死和自己最親近的朋友（這個也有爭議的）。他殺死了他最要好的朋友止水開了萬花筒寫輪眼。他還殺了宇智波一族除了佐助以外的所有人（此處有爭議，一般認為是曉乾的，但也有說是木葉要求的。後來漫畫中斑說出真相是木葉要求的），並且慫恿佐助也透過這種方式獲得萬花筒寫輪眼。而卡卡西顯然不是透過這種方式開眼的永恆萬花筒寫輪眼。因為在動畫一開始的時候，卡卡西就說過，他所在意的人早已經全部不在人世了。動漫中也沒有提到，卡卡西在從第一部到第二部的兩年半時間內是如何得到萬花筒寫輪眼的。在宇智波家族漫長的歷史上，很少有人能夠使用萬花筒寫輪眼。目前出場的人物可知能用到萬花筒寫輪眼的人有卡卡西、鼬、佐助、團藏、宇智波斑。鼬曾經告訴佐助，如果後者開眼，那麼能夠使用萬花筒寫輪眼的人就有三個了。此外似乎還有一個人 團藏 現在佐助由於斑的花言巧語而對木葉的恨，以及對哥哥多年誤會的悲痛而開眼。斑和他弟弟是經過相互進步而開眼。萬花筒寫輪眼是寫輪眼的較高模式，而最高階的是永恆萬花筒寫輪眼