元朝存在的時間並不長，雖然在當時征服的地域非常的寬廣，但也算是一個比較短命的王朝。對古代的考古發現，主要還是透過古墓古遺址以及在這些地方發現的物品來進行考古研究。但到目前為止對於元朝的考古發現並不多。主要是因為在中國大部分地區，對於亡故的人，一般採用土葬的習俗，講究入土為安。而蒙古族的傳統的喪葬習俗則是天葬——人死後，用白布裹身，放到荒野，任鳥獸啄食。蒙古人相信草原狼是天神騰格里派來的使者，屍體只有經過狼的處理才可以去騰格里，而元朝的皇帝很可能也是經由草原狼處理。蒙古族認為自己生前吃肉，死後就要將自己的肉還給禽獸。所以發展的元朝墓葬基本沒有。

直到上世紀80年代，河北省考古工作者發現白城子村出土的文物以元代為主，而且部分建築殘片為漢白玉螭首，由此推測這裡曾經有過元代皇家建築。1997年，考古專家進行了實地勘察和論證，認定白城子為元中都遺址。 隨後，河北省文物研究所等單位組織考古隊對元中都遺址進行了勘探發掘，出土了大量宮殿建築構件，初步探明瞭角樓遺址、南門遺址和中心大殿遺址，這一發掘成果列入“1999年度全國十大考古新發現”。2001年，元中都遺址被國務院公佈為全國重點文物保護單位。 為保護和展示元中都遺址，經國家文物局批准，元中都打造國家考古遺址公園，並於2013年正式開工建設。元中都國家考古遺址公園專案規劃建設用地13485畝，總投資3.6億。 “一座中都城，半部元朝史。”元朝持續時間不足100年，元中都見證了一半。如今，元中都的建制、停廢等一系列問題，仍需要進一步的考古探究。

封建王朝的皇帝死後一般都有陵墓，唯獨元朝皇帝沒有留下一座陵墓。這是一個千古之謎。明朝葉子奇《草木子》中記載：元朝皇帝駕崩，“用囉木兩片，鑿空其中，類人形大小合為棺，置遺體其中……加髹漆，畢，則以黃金為圈，三圈定（箍兩頭、中間）”。然後，掘深溝一道埋葬，“以萬馬蹂之使平。殺駱駝於其上，以千騎守之。來歲草既生，則移帳散去，彌望平衍，人莫知也”。

當年成吉思汗去世，就是採用了這種方式下葬。據記載，成吉思汗在寧夏病逝後，其遺體被運往漠北肯特山下某處，在地表挖深坑密葬。其遺體存放在一個將大樹中間掏空做成的獨木棺裡。獨木棺下葬後，土回填，然後“萬馬踏平”。為了不讓外人看出曾經動土的痕跡，還要用帳篷將周圍地區全部圍起來，待到墓葬地面上的青草長出，與周圍的青草無異，才將帳篷撤走，這樣墓葬的地點就不會洩露了。

全套工作完成後，蒙古人在墓葬地表殺死一頭小駱駝，這時，陪伴這頭小駱駝前來的母駱駝就會十分悲痛地號叫，並且記住這個地點。第二年來祭祀的時候，把這頭母駱駝牽來，在殺死小駱駝的地點，母駱駝就會悲痛地流淚。這樣，前來祭祀的人就能找到墓葬的確切地點