小蘭肯定是有懷疑過柯南的身份的，並且很多次都認為柯南就是工藤新一。如下是我從動畫中的截圖，明顯可以看出小蘭有起疑心，雖然最後都被化解了！

但是要說到哪一次要被穿幫，我覺得是第七話的“每月一件禮物威脅事件”。這集中，柯南剛進入小蘭的生活沒多久，而在調查一件案件時，柯南表現出了超強的推理能力，並且有著超強的資料查閱能力，更要命的是小蘭故意套話，把柯南叫成了新一，柯南下意識的答應了，直接暴露了自己的真實身份。為了避免尷尬，柯南只好裝瘋賣傻玩起了電子遊戲。

隨著案件的進展，柯南又展現出了超強的智力和體力，最後還成功破案，救下了人質小孩，這更讓小蘭確信了柯南就是新一的真實身份。於是小蘭與柯南對峙，一直追問他的真實身份，就在謊言要被揭穿的時候，阿笠博士用變聲器偽裝成新一給小蘭打了電話，這才避免了身份暴露！（這是柯南拜託阿笠博士做的）

大家好，我是動漫雜談，很榮幸為大家回答這個問題！

柯南原為高中生名偵探工藤新一，因招惹到黑衣組織，被其灌下藥而導致身體變小！為了不被黑衣組織發現，新一改名為柯南，並寄居於女朋友毛利蘭家裡！

那麼在柯南居住在小蘭家裡的這段時間，小蘭有沒有懷疑過柯南就是新一呢？答案是毋庸置疑的！

接下來給大家介紹柯南最接近被揭穿的幾次。（以下排名不分先後！）

1:走投無路的名偵探（96集）

柯南在睡覺時被小蘭摘下了眼睛，小蘭感覺他和小時候的新一十分相像！

同時小蘭找到了10年前新一與一位魔術師的合影。經過對比，使得小蘭更加堅信了柯南就是新一！至於變小的原因很可能是吃了博士發明的怪藥！

就在小蘭將要識破柯南，千鈞一髮之際！工藤有希子出現，並謊稱柯南是自家的親戚，幫柯南圓了過去，使得小蘭信以為真！

2:心存疑惑的蘭（400集）

小蘭給新一發了一個郵件，結果柯南的手機響了起來！這引起了小蘭的注意！經過仔細的觀察後，小蘭發現柯南的手機和新一的一模一樣！

配合著柯南慌張的行為和表情，使得小蘭再一次懷疑柯南就是新一！

所幸柯南機智，他將新一的聲音錄到磁帶裡，並用自己的電話給小蘭打電話！與此同時放出磁帶的聲音，之後自己再出現在小蘭的面前！成功的消除了小蘭的疑惑！

3:世紀末的魔術師（劇場版）

柯南不小心說出了自己的生日，經過比對，小蘭發現柯南的生日和新一的一模一樣！

結合這柯南的動作，推理，語言，小蘭對此產生了極大的懷疑。小蘭不禁含淚問到“你就是新一吧”？

就當柯南一籌莫展，忍不住招供時，基德冒充成新一出現在小蘭面前！再次打消了小蘭的懷疑，使得柯南沒有暴露！

而基德做這一切是因為柯南救了一個鴿子！