一是北方民族當時已經沒多大實力南下了，二是除了燕王，當時還有遼、寧、谷、代、晉、秦、慶、肅等八位藩王（當然了，像寧王朱權被朱棣給玩了）護邊呢

要想知道這個問題我們把時間點定到建文四年(1402年)朱棣勝利的那一年，瓦剌和北元在幹什麼。1388年，藍玉率15萬大軍北擊北元，北元朝廷幾乎全部覆滅。北元殘餘疆域分裂。

從地圖上看北元地盤損失殆盡，同年，北元后主被阿里不哥殺害，去北元國號改稱蒙古。也就是說靖難之戰，北元已經不存在了更別說南下了。至於韃靼當時和瓦剌內戰爭奪草原主導權。朱棣篡位後1414年朱棣擊敗韃靼，瓦剌稱臣。可是這次北征打破了北疆的實力平衡，韃靼式微，瓦剌坐大，而後數十年，瓦剌韃靼相互征戰，瓦剌逐步南下吞併了韃靼，而後明朝土木堡之戰被瓦剌擊敗，從此失去了對北疆的掌控。

朱棣久經沙場，北方民族對其有敬畏之心，是不敢輕舉妄動的，況且又沒有內應。誰也不想去冒險，再說他們剛經歷過戰爭也需要休養生息。

朱棣發動靖之役是建文元年（1399年），至建文四年（1402年），朱棣取得勝利。這段時間，元朝殘餘勢力不是不想，而是他們根本沒有力量南侵。

明初，朱元璋就不遺餘力持續打擊元朝殘餘勢力，先後派出徐達、藍玉、沐英等大將率明軍北進橫掃元朝勢力，將元朝末代皇帝元順帝趕回了蒙古老家。最後，北元殘餘勢力分裂，分成了韃靼、瓦剌兩個主要部分，其他一些北方少數民族有的歸附韃靼和瓦剌，有的則歸附明朝。

初時，韃靼和瓦剌雖然已經對明朝沒法構成致命威脅了，但還是會不時搔擾明朝邊境的。所以，朱元璋對北方少數民族政權（韃靼和瓦剌為主）勢力仍是保持高度警惕和防備的。為此，朱元璋專門在北疆設立了羈縻衛所，以當地首領為地方官員，賜給敕書印記，轄都司衛所，掌當地軍民政事。目的就是讓這些少數民族分治不統一，以免構成邊患。此外，朱元璋還把他的兒子們分派到各地邊境為王，一來讓他們得到鍛鍊，二來也是為了加強邊疆防衛。

而朱棣在燕王位上就顯示出了他的雄才大略，與他皇帝老爹朱元璋一樣，對北方少數民族政權也是一點不客氣。《明史》就記載，洪武二十三年（1390年），朱棣與晉王一起討伐北元乃兒不花，晉王害怕不敢前進，而朱棣則“倍道趨迤都山，獲其全部而還”，乃兒不花是元朝殘餘勢力北元的太尉，此役沉重打擊了北元勢力。故此，史上有“燕王掃北”的說法，說朱棣當燕王時就曾兩次率兵北征，打擊龜縮在蒙古草原的蒙元勢力，均取得了勝利。不但奠定了朱棣在北方的軍事威望，也為他日後發動“靖難之役”打下了強大基礎。據傳，當時北方許多少數民族不但害怕朱棣，還崇拜朱棣，朱棣率軍南下時，軍中就有不少北方少數民族的將士。比如乃兒不花的許多部屬，就歸順朱棣賬下。加上韃靼和瓦剌的分裂，當時的北元殘餘勢力根本是威脅不到朱棣的。