事業單位在年度終了前，應根據財政部門或主管部門的決算編審工作要求，對各項收支賬目、往來款項、貨幣資金和財產物資進行全面的年終清理結算，在此基礎上辦理年度結賬，編報決算。

年終清理結算的主要事項包括：

清理、核對年度預算收支數字和各項繳撥款項、上交下撥款項數字。年終前，對財政部門、上級單位和所屬各單位之間的全年預算數(包括追加追減和上、下劃數字)以及應上交、撥補的款項等，都應按規定逐筆進行清理結算，保證上下級之間的年度預算數、領撥經費數和上交、下撥數一致。

為了準確反映各項收支數額，凡屬本年度的應撥應交款項，應當在12月31日前匯達對方。主管會計單位對所屬各單位的撥款應截至12月25日為止，逾期一般不再下撥。

凡屬本年的各項收入都應及時入賬。本年的各項應繳預算款和應繳財政專戶的預算外資金收入，應在年終前全部上繳。屬於本年的各項支出，應按規定的支出用途如實列報。

年度單位支出決算，一律以基層用款單位截至12月31日的本年實際支出數為準，不得將年終前預撥下年的預算撥款列入本年的支出，也不得以上級會計單位的撥款數代替基層會計單位的實際支出數。

事業單位的往來款項，年終前應儘量清理完畢。按照有關規定應當轉作各項收入或各項支出的往來款項要及時轉入各有關賬戶，編入本年決算。

事業單位年終應及時同開戶銀行對賬，銀行存款賬面餘額應同銀行對賬單的餘額核對相符。現金賬面餘額應同庫存現金核對相符。有價證券賬面數字，一般應同實存的有價證券核對相符。

年終前，應對各項財產物資進行清理盤點。發生盤盈、盤虧的，應及時查明原因，按規定作出處理，調整賬務，做到賬實相符，賬賬相符。

事業單位在年終清理結算的基礎上進行年終結賬。年終結賬包括年終轉賬、結清舊賬和記入新賬。

年終轉賬。賬目核對無誤後，首先計算出各賬戶借方或貸方的12月份合計數和全年累計數，結出12月末的餘額。然後，編制結賬前的“資產負債表”，試算平衡後，再將應對沖結轉的各個收支賬戶的餘額按年終衝轉辦法，填制12月31日的記賬憑單辦理結賬衝轉。

結清舊賬。將轉賬後無餘額的賬戶結出全年總累計數，然後在下面劃雙紅線，表示本賬戶全部結清。對年終有餘額的賬戶，在“全年累計數”下行的“摘要”欄內註明“結轉下年”字樣，再在下面劃雙紅線，表示年終餘額轉入新賬，舊賬結束。

記入新賬。根據本年度各賬戶餘額，編制年終決算的“資產負債表”和有關明細表。將表列各賬戶的年終餘額數(不編制記賬憑單)，直接記入新年度相應的各有關賬戶，並在“摘要”欄註明“上年結轉”字樣，以區別新年度發生數。

事業單位的決算經財政部門或上級單位審批後，需調整決算數字時，應作相應調整。