真空包裝，一般來說做的時候保持衛生使月餅不收受汙染烤出來以後趁熱用噴水壺噴點酒（水酒混合）在採用真空包裝，不漏氣可以放一年都不會有問題，這裡指的是水果餡月餅，像豆沙之類的，需要特別對待

要將月餅存放在低溫、通風、陰涼的地方，最好將月餅連帶包裝盒一起放入冰箱冷藏室，食用前一小時取出，可保證它的口味。月餅存放時，不宜與其他食品、雜物放在一起，以免串味。另外注意的是：在25℃的氣溫下，百果、杏仁等餡心月餅可存放15天左右，棗泥、豆沙、蓮蓉等餡心月餅存放時間不宜超過10天，在30℃以上的溫度下，月餅存放時間不宜超過7天。

水分低、糖分高的傳統月餅微生物繁殖慢，保質期較長；反之，水分大的新式月餅容易變質或長黴，收貨要檢查是否變味，如不馬上食用，必須冷藏或冷凍。 ​​​

一時食用不完時，可採用以下方法儲存：

1、將月餅放進潔淨的食品袋內放入冰箱的保鮮櫃內儲存；硬式月餅可放入紙盒內儲存，可儲存十來天不變壞。最好不要冷凍月餅，月餅冷凍後口感會發生變化。

2、 如果是散裝的月餅，首先將月餅放入塑膠罐中，然後在上面撒上冰糖就行了，冰糖是可以吸收水分的。

3、如果是鹹月餅，就在月餅上先蓋上一層保鮮膜，然後在放冰糖。這樣就可以直接把月餅放在室內，而不用放在冰箱了。

月月餅含有豐富的油脂和糖分，受熱受潮易發黴、變質。開封后未吃完的月餅，要按照產品包裝上標示的儲存方法儲存。建議將月餅裝入未使用過的食品袋，放入冰箱中冷藏儲存。如無冰箱，也可將月餅放在陰涼通風處儲存。同時不宜與其他食品、雜物存放在一起，以免串味，影響其口味。近年來，家庭自制月餅成為時尚。選用海鮮、乳酪、肉鬆、堅果、薯類等食材，動手製作造型多樣的月餅，既可以增加家庭歡樂，又能帶來獨特風味。

然而，家庭製作不能全面保證食品安全。在選擇原料時要注意堅果油籽等的新鮮度。在製作過程中，所有器具要與製作生魚肉蛋類的菜板、容器等分開，避免交叉汙染。焙烤時間要充分，以保證殺菌效果等。其中，焙烤類月餅如果當天沒有食用完，建議要冷藏儲存，再次從冰箱中取出後，建議用烤箱適當加熱，以提升溫度、增加香氣；未經焙烤、水分很大的果蔬餡、薯泥餡等軟質月餅，最好當餐食用完。在購買網路銷售的自制月餅時，一定要確認製作者具有網路食品銷售的資質，還要仔細檢視產品保質期。如果屬於非焙烤型、水分含量高的月餅，必須具有冷藏包裝，避免在儲藏和運輸過程中出現微生物超標。購買之後要當天食用，必要時用微波加熱方式進行殺菌處理。記得吃新莫久放。新鮮月餅圓正飽滿，味美可口，放久了則失去香味特色，餡也容易變質，建議開封之後最好立即食用。配熱不配冷。月餅富含脂肪，吃時不宜配冷飲，否則容易引起腹瀉。最好泡一杯熱茶或備一杯開水，邊吃邊飲，使月餅更為香甜適口。食用要適量。有一些月餅中含有較多的油脂、蔗糖，不宜過量食用，否則容易引起腸胃不適。特別是老人、兒童、腸胃功能弱者，更要注意適量為宜