朱棣深知屠侄篡位，在歷史上必然汙點赫然，對朱家皇族而言是罪孽深重，所以，必須採用最強硬、最殘暴、最有威懾性的手段和懲罰，才能最大限度地堵住悠悠之口，把讀書人嚇得膽戰心驚、魂飛魄散，才有可能儘量洗白、掩蓋這段不光彩的歷史。

故而，朱棣必須用最具代表性的知識分子作為祭品，強力表達不計一切、不擇手段、不達目的不罷休的決心和血腥。

所以，方孝孺是必死無疑的，他自己也很清楚，屈服是死、不屈服也是死，只有青史留名一條路。

這個問題就跟問“女真入侵，岳飛為啥不投降？”一樣，朱棣謀朝篡位，為一己私心挑起數載干戈，殺人數十萬，罪大惡極，方正學先生作為儒生的代表，道統的化身，怎麼可能向魔王屈服？

考察建文前後史事，朱元璋從沒有傳位朱棣的意思，很多朱元璋欣賞朱棣勝過朱允炆的段子已經被證實是朱棣編造的，朱棣的親媽也不是馬皇后而是蒙古妃子，也就是說朱棣只是個庶子，毫無奪位的希望。

而建文帝則是朱元璋寄予厚望的繼承人，因為朱元璋老年風格轉變，準備推行儒家仁政，有助於坐穩江山，本來是準備讓太子朱標來推行，並且幫助朱標培養了未來的輔政官僚集團即懿文東宮集團，但是朱標英年早逝，朱元璋遂轉而悉心培養建文帝，並且對建文帝即位後重新整理政治抱有極大的期望，建文帝即位後各種政策也深得民心，但是最終被朱棣在軍事上戰勝，作為建文帝那些深入民心的改革的重要助手方孝孺，同時還是一代儒宗，怎麼可能臣服朱棣？

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在正史裡，沒有朱棣滅方孝孺十族的任何記載，方孝孺的族人和學生死了很多倒是真的，至於方孝孺為何寧死不屈，我們要從在《方孝孺傳》中的記載找答案。

一開始，朱棣並不想殺方孝孺，因為他是天下讀書人的領袖，大儒。姚廣孝曾跟朱棣說過：“破城之日，方孝孺必然不會投降，千萬別殺，如果殺了方孝孺，天下的讀書人都會記恨”。朱棣對此甚為贊同，想讓方孝孺寫詔書，讓自己繼承大統更名正言順。可惜，想法很美好，現實太骨感！當方孝孺進入大殿時，嚎聲大哭，朱棣寬慰他說：“先生不用痛苦，我是效仿周公輔佐成王”。方孝孺反問道：“成王在哪？”，朱棣回答，自焚死。方孝孺問，為什麼不立成王子嗣為帝？

朱棣說：“皇帝應該為成年人”。方孝孺問：“為何不立成王之弟？”朱棣說：“這是我的家事”。然後讓手下拿過筆來，說：“詔書一定要由先生來寫”。方孝孺把筆往地上一扔，邊哭邊罵，死就死，絕對不會寫。朱棣大怒，命人拉出去車裂在街市，方孝孺慨然赴死，臨死做絕命詩。

以上為正史中，朱棣與方孝孺的對話發展過程。可見方孝孺早已抱著必死之心，對待朱棣完全不客氣，給自己不留任何餘地。方孝孺之所以這麼做有如下原因：

1、方孝孺的性格品行極為端正，忠心為主是他的人生信條。眼光老練的朱元璋對方孝孺十分欣賞，曾對朱標說：“此莊士，當老其才”。意思為，方孝孺品行端莊，可以用到老。方孝孺被仇家舉報，逮捕進京，朱元璋都把他放了，可見對方孝孺的認可程度。如此性格，不屈服也不足為怪。

2、建文帝朱允炆對方孝孺有知遇之恩，與方孝孺的感情更是亦師亦友，國家大事都會與方孝孺商量。朱允炆讀書時，遇到難題也會請方孝孺講解，他們之間如此深厚的感情，也支撐方孝孺硬抗朱棣的威迫，誓死不屈。

3、方孝孺的家風決定了不會屈服，全家都是剛烈之人。哥哥方孝聞先一步負死，弟弟方孝友與方孝孺同死，也做絕命詩一首。妻子和兩個兒子自盡死，兩個女兒投淮河死。如此可以看出，骨子裡的剛毅決定了方孝孺不會屈服。