一、對天人關係理論的評價

優點是把表面上看起來孤立的自然界諸事物以及人體看做是一個相互聯絡的統一整體，注意研究它們之間的普遍聯絡和共同規律，缺陷是限於直觀的研究方法，不可能深入瞭解自然界諸事物以及人體的細節。

二、對氣哲學的評價

《內經》在哲學的基礎上，提出了形氣轉化理論，但僅從量上觀察，不從質上加以區別，因而不能科學的解釋物質世界及其運動的無限多樣性。

三、對陰陽哲學的評價

陰陽作為自然界相互關聯的某些事物和現象對立雙方的抽象和概括，具有對立、依存，消長，轉化的性質，是事物運動變化的源泉和總規律，但由於陰陽學說是先秦時代的產物，由於生產力水平低下，也沒有建立在嚴密實驗基礎上的自然科學，限制了人們的眼界和抽象思維的能力，因此，陰陽學說不可能超出時代直觀的深度和廣度，不可能進行最一般的抽象，總是帶有特殊的規定性。

四、對五行哲學的評價

《內經》五行學說的五行歸類是以功能行為的相同或相似為依據，缺乏對事物本質實質的瞭解，不可能反映世界的結構。

五、對《內經》比類的評價

由於類的標準不一定真實可靠，類的同異關係也只是建立在天人合一的基礎上的功能行為的相同或相似，缺乏對自然界的深入瞭解，有誇大世界同一性的傾向，往往得出並不真實的結論，或者陷於荒唐的邏輯推理。